Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZZ0

HOXD1, Homeobox protein Hox-D1, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD1Q9GZZ0 THAP4-204ENST00000407315 2367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
HOXD1Q9GZZ0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
HOXD1Q9GZZ0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD1Q9GZZ0 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD1Q9GZZ0 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD1Q9GZZ0 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD1Q9GZZ0 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD1Q9GZZ0 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
HOXD1Q9GZZ0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD1Q9GZZ0 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD1Q9GZZ0 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD1Q9GZZ0 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD1Q9GZZ0 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
HOXD1Q9GZZ0 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD1Q9GZZ0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD1Q9GZZ0 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
HOXD1Q9GZZ0 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
HOXD1Q9GZZ0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD1Q9GZZ0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD1Q9GZZ0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD1Q9GZZ0 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
HOXD1Q9GZZ0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD1Q9GZZ0 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD1Q9GZZ0 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
HOXD1Q9GZZ0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD1Q9GZZ0 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD1Q9GZZ0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
HOXD1Q9GZZ0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD1Q9GZZ0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD1Q9GZZ0 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD1Q9GZZ0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.69■■□□□ 1.38
HOXD1Q9GZZ0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD1Q9GZZ0 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD1Q9GZZ0 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD1Q9GZZ0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HOXD1Q9GZZ0 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD1Q9GZZ0 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD1Q9GZZ0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HOXD1Q9GZZ0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD1Q9GZZ0 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD1Q9GZZ0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD1Q9GZZ0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD1Q9GZZ0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD1Q9GZZ0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD1Q9GZZ0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HOXD1Q9GZZ0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD1Q9GZZ0 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD1Q9GZZ0 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HOXD1Q9GZZ0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXD1Q9GZZ0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
HOXD1Q9GZZ0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
HOXD1Q9GZZ0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
HOXD1Q9GZZ0 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms