Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZT6

CCDC90B, Coiled-coil domain-containing protein 90B, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC90BQ9GZT6 LINC01578-201ENST00000553829 732 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 NRGN-201ENST00000284292 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 CADPS-219ENST00000612439 5455 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 AC079848.1-201ENST00000511301 327 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
CCDC90BQ9GZT6 CGREF1-204ENST00000402550 1575 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC90BQ9GZT6 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC90BQ9GZT6 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CCDC90BQ9GZT6 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC90BQ9GZT6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC90BQ9GZT6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC90BQ9GZT6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CCDC90BQ9GZT6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC90BQ9GZT6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC90BQ9GZT6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC90BQ9GZT6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC90BQ9GZT6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CCDC90BQ9GZT6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CCDC90BQ9GZT6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC90BQ9GZT6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC90BQ9GZT6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CCDC90BQ9GZT6 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC90BQ9GZT6 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC90BQ9GZT6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC90BQ9GZT6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CCDC90BQ9GZT6 FAM89B-201ENST00000316409 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CCDC90BQ9GZT6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC90BQ9GZT6 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC90BQ9GZT6 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC90BQ9GZT6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CCDC90BQ9GZT6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC90BQ9GZT6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC90BQ9GZT6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CCDC90BQ9GZT6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC90BQ9GZT6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC90BQ9GZT6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC90BQ9GZT6 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CCDC90BQ9GZT6 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC90BQ9GZT6 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC90BQ9GZT6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC90BQ9GZT6 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CCDC90BQ9GZT6 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC90BQ9GZT6 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC90BQ9GZT6 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
CCDC90BQ9GZT6 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC90BQ9GZT6 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC90BQ9GZT6 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
CCDC90BQ9GZT6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
CCDC90BQ9GZT6 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC90BQ9GZT6 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC90BQ9GZT6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC90BQ9GZT6 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
CCDC90BQ9GZT6 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC90BQ9GZT6 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
CCDC90BQ9GZT6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC90BQ9GZT6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC90BQ9GZT6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC90BQ9GZT6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
CCDC90BQ9GZT6 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC90BQ9GZT6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC90BQ9GZT6 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
CCDC90BQ9GZT6 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC90BQ9GZT6 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
CCDC90BQ9GZT6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC90BQ9GZT6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC90BQ9GZT6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC90BQ9GZT6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
CCDC90BQ9GZT6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
CCDC90BQ9GZT6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.8 ms