Protein–RNA interactions for Protein: Q9C019

TRIM15, Tripartite motif-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM15Q9C019 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM15Q9C019 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM15Q9C019 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM15Q9C019 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TRIM15Q9C019 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TRIM15Q9C019 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
TRIM15Q9C019 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
TRIM15Q9C019 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
TRIM15Q9C019 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.7 ms