Protein–RNA interactions for Protein: Q9C009

FOXQ1, Forkhead box protein Q1, humanhuman

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Length 403 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXQ1Q9C009 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXQ1Q9C009 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.44■■□□□ 1.82
FOXQ1Q9C009 RASSF7-202ENST00000397583 1928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXQ1Q9C009 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXQ1Q9C009 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXQ1Q9C009 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
FOXQ1Q9C009 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXQ1Q9C009 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
FOXQ1Q9C009 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXQ1Q9C009 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXQ1Q9C009 MSRB2-201ENST00000376510 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXQ1Q9C009 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
FOXQ1Q9C009 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
FOXQ1Q9C009 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
FOXQ1Q9C009 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
FOXQ1Q9C009 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXQ1Q9C009 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXQ1Q9C009 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXQ1Q9C009 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXQ1Q9C009 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXQ1Q9C009 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
FOXQ1Q9C009 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXQ1Q9C009 SSBP3-204ENST00000371320 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXQ1Q9C009 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXQ1Q9C009 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
FOXQ1Q9C009 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXQ1Q9C009 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
FOXQ1Q9C009 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXQ1Q9C009 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXQ1Q9C009 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXQ1Q9C009 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
FOXQ1Q9C009 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXQ1Q9C009 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXQ1Q9C009 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXQ1Q9C009 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXQ1Q9C009 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
FOXQ1Q9C009 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
FOXQ1Q9C009 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXQ1Q9C009 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXQ1Q9C009 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
FOXQ1Q9C009 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXQ1Q9C009 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXQ1Q9C009 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXQ1Q9C009 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
FOXQ1Q9C009 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
FOXQ1Q9C009 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXQ1Q9C009 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXQ1Q9C009 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
FOXQ1Q9C009 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
FOXQ1Q9C009 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXQ1Q9C009 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXQ1Q9C009 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
FOXQ1Q9C009 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXQ1Q9C009 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXQ1Q9C009 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
FOXQ1Q9C009 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXQ1Q9C009 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
FOXQ1Q9C009 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXQ1Q9C009 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.17■■□□□ 1.78
FOXQ1Q9C009 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXQ1Q9C009 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXQ1Q9C009 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXQ1Q9C009 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
FOXQ1Q9C009 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXQ1Q9C009 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXQ1Q9C009 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXQ1Q9C009 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
FOXQ1Q9C009 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXQ1Q9C009 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXQ1Q9C009 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXQ1Q9C009 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
FOXQ1Q9C009 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
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