Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZB8

CPEB1, Cytoplasmic polyadenylation element-binding protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 566 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPEB1Q9BZB8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CPEB1Q9BZB8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPEB1Q9BZB8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPEB1Q9BZB8 LRRC10B-201ENST00000378075 2219 ntAPPRIS P1 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPEB1Q9BZB8 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPEB1Q9BZB8 GDI1-215ENST00000630693 786 ntTSL 4 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPEB1Q9BZB8 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CPEB1Q9BZB8 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPEB1Q9BZB8 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPEB1Q9BZB8 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CPEB1Q9BZB8 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPEB1Q9BZB8 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
CPEB1Q9BZB8 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPEB1Q9BZB8 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CPEB1Q9BZB8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPEB1Q9BZB8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPEB1Q9BZB8 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.95■■□□□ 1.74
CPEB1Q9BZB8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
CPEB1Q9BZB8 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
CPEB1Q9BZB8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPEB1Q9BZB8 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPEB1Q9BZB8 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPEB1Q9BZB8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
CPEB1Q9BZB8 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPEB1Q9BZB8 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPEB1Q9BZB8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CPEB1Q9BZB8 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPEB1Q9BZB8 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
CPEB1Q9BZB8 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
CPEB1Q9BZB8 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPEB1Q9BZB8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPEB1Q9BZB8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
CPEB1Q9BZB8 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPEB1Q9BZB8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPEB1Q9BZB8 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
CPEB1Q9BZB8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
CPEB1Q9BZB8 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
CPEB1Q9BZB8 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
CPEB1Q9BZB8 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPEB1Q9BZB8 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
CPEB1Q9BZB8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPEB1Q9BZB8 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
CPEB1Q9BZB8 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPEB1Q9BZB8 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPEB1Q9BZB8 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
CPEB1Q9BZB8 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPEB1Q9BZB8 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPEB1Q9BZB8 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPEB1Q9BZB8 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
CPEB1Q9BZB8 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPEB1Q9BZB8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPEB1Q9BZB8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC25.84■■□□□ 1.73
CPEB1Q9BZB8 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPEB1Q9BZB8 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
CPEB1Q9BZB8 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
CPEB1Q9BZB8 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
CPEB1Q9BZB8 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPEB1Q9BZB8 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPEB1Q9BZB8 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPEB1Q9BZB8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPEB1Q9BZB8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPEB1Q9BZB8 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
CPEB1Q9BZB8 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPEB1Q9BZB8 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPEB1Q9BZB8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC25.8■■□□□ 1.72
CPEB1Q9BZB8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
CPEB1Q9BZB8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPEB1Q9BZB8 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPEB1Q9BZB8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
CPEB1Q9BZB8 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPEB1Q9BZB8 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPEB1Q9BZB8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPEB1Q9BZB8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
CPEB1Q9BZB8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
CPEB1Q9BZB8 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPEB1Q9BZB8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPEB1Q9BZB8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
CPEB1Q9BZB8 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPEB1Q9BZB8 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
CPEB1Q9BZB8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPEB1Q9BZB8 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
CPEB1Q9BZB8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPEB1Q9BZB8 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
CPEB1Q9BZB8 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
CPEB1Q9BZB8 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPEB1Q9BZB8 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPEB1Q9BZB8 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPEB1Q9BZB8 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPEB1Q9BZB8 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPEB1Q9BZB8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPEB1Q9BZB8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
CPEB1Q9BZB8 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPEB1Q9BZB8 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPEB1Q9BZB8 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
CPEB1Q9BZB8 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPEB1Q9BZB8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPEB1Q9BZB8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
CPEB1Q9BZB8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
CPEB1Q9BZB8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
CPEB1Q9BZB8 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms