Protein–RNA interactions for Protein: Q9BWE0

REPIN1, Replication initiator 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 567 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REPIN1Q9BWE0 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
REPIN1Q9BWE0 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
REPIN1Q9BWE0 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
REPIN1Q9BWE0 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REPIN1Q9BWE0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
REPIN1Q9BWE0 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
REPIN1Q9BWE0 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REPIN1Q9BWE0 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REPIN1Q9BWE0 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
REPIN1Q9BWE0 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REPIN1Q9BWE0 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
REPIN1Q9BWE0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REPIN1Q9BWE0 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REPIN1Q9BWE0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
REPIN1Q9BWE0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
REPIN1Q9BWE0 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
REPIN1Q9BWE0 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REPIN1Q9BWE0 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REPIN1Q9BWE0 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
REPIN1Q9BWE0 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REPIN1Q9BWE0 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
REPIN1Q9BWE0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
REPIN1Q9BWE0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REPIN1Q9BWE0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REPIN1Q9BWE0 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REPIN1Q9BWE0 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REPIN1Q9BWE0 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REPIN1Q9BWE0 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
REPIN1Q9BWE0 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
REPIN1Q9BWE0 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
REPIN1Q9BWE0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
REPIN1Q9BWE0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REPIN1Q9BWE0 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
REPIN1Q9BWE0 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
REPIN1Q9BWE0 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
REPIN1Q9BWE0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
REPIN1Q9BWE0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
REPIN1Q9BWE0 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
REPIN1Q9BWE0 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
REPIN1Q9BWE0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
REPIN1Q9BWE0 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
REPIN1Q9BWE0 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
REPIN1Q9BWE0 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REPIN1Q9BWE0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REPIN1Q9BWE0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
REPIN1Q9BWE0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REPIN1Q9BWE0 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
REPIN1Q9BWE0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
REPIN1Q9BWE0 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
REPIN1Q9BWE0 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
REPIN1Q9BWE0 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REPIN1Q9BWE0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REPIN1Q9BWE0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REPIN1Q9BWE0 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
REPIN1Q9BWE0 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REPIN1Q9BWE0 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
REPIN1Q9BWE0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
REPIN1Q9BWE0 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REPIN1Q9BWE0 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
REPIN1Q9BWE0 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
REPIN1Q9BWE0 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.8 ms