Protein–RNA interactions for Protein: Q9BUL8

PDCD10, Programmed cell death protein 10, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD10Q9BUL8 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD10Q9BUL8 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
PDCD10Q9BUL8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD10Q9BUL8 CATIP-201ENST00000289388 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD10Q9BUL8 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
PDCD10Q9BUL8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD10Q9BUL8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD10Q9BUL8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD10Q9BUL8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD10Q9BUL8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
PDCD10Q9BUL8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD10Q9BUL8 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD10Q9BUL8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
PDCD10Q9BUL8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCD10Q9BUL8 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCD10Q9BUL8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
PDCD10Q9BUL8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCD10Q9BUL8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCD10Q9BUL8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCD10Q9BUL8 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCD10Q9BUL8 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCD10Q9BUL8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCD10Q9BUL8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCD10Q9BUL8 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
PDCD10Q9BUL8 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
PDCD10Q9BUL8 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCD10Q9BUL8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCD10Q9BUL8 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCD10Q9BUL8 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
PDCD10Q9BUL8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD10Q9BUL8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD10Q9BUL8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD10Q9BUL8 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD10Q9BUL8 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD10Q9BUL8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD10Q9BUL8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD10Q9BUL8 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
PDCD10Q9BUL8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCD10Q9BUL8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCD10Q9BUL8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCD10Q9BUL8 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCD10Q9BUL8 ANKS1B-202ENST00000333732 1675 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCD10Q9BUL8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCD10Q9BUL8 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC21.45■■□□□ 1.02
PDCD10Q9BUL8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCD10Q9BUL8 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
PDCD10Q9BUL8 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCD10Q9BUL8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCD10Q9BUL8 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCD10Q9BUL8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PDCD10Q9BUL8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCD10Q9BUL8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCD10Q9BUL8 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCD10Q9BUL8 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCD10Q9BUL8 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PDCD10Q9BUL8 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCD10Q9BUL8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCD10Q9BUL8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCD10Q9BUL8 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PDCD10Q9BUL8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCD10Q9BUL8 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCD10Q9BUL8 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PDCD10Q9BUL8 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PDCD10Q9BUL8 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCD10Q9BUL8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCD10Q9BUL8 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCD10Q9BUL8 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCD10Q9BUL8 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PDCD10Q9BUL8 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCD10Q9BUL8 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCD10Q9BUL8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PDCD10Q9BUL8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCD10Q9BUL8 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PDCD10Q9BUL8 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCD10Q9BUL8 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCD10Q9BUL8 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCD10Q9BUL8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCD10Q9BUL8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCD10Q9BUL8 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PDCD10Q9BUL8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCD10Q9BUL8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCD10Q9BUL8 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCD10Q9BUL8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCD10Q9BUL8 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
PDCD10Q9BUL8 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCD10Q9BUL8 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCD10Q9BUL8 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCD10Q9BUL8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PDCD10Q9BUL8 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCD10Q9BUL8 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCD10Q9BUL8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PDCD10Q9BUL8 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDCD10Q9BUL8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
PDCD10Q9BUL8 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCD10Q9BUL8 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
PDCD10Q9BUL8 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCD10Q9BUL8 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDCD10Q9BUL8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
PDCD10Q9BUL8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PDCD10Q9BUL8 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.6 ms