Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTK6

PAGR1, PAXIP1-associated glutamate-rich protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAGR1Q9BTK6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.9■■■□□ 2.38
PAGR1Q9BTK6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PAGR1Q9BTK6 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.38
PAGR1Q9BTK6 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.89■■■□□ 2.37
PAGR1Q9BTK6 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PAGR1Q9BTK6 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PAGR1Q9BTK6 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC29.88■■■□□ 2.37
PAGR1Q9BTK6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
PAGR1Q9BTK6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.87■■■□□ 2.37
PAGR1Q9BTK6 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
PAGR1Q9BTK6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PAGR1Q9BTK6 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC29.86■■■□□ 2.37
PAGR1Q9BTK6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PAGR1Q9BTK6 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
PAGR1Q9BTK6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PAGR1Q9BTK6 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
PAGR1Q9BTK6 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PAGR1Q9BTK6 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.84■■■□□ 2.37
PAGR1Q9BTK6 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC29.84■■■□□ 2.37
PAGR1Q9BTK6 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
PAGR1Q9BTK6 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
PAGR1Q9BTK6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PAGR1Q9BTK6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
PAGR1Q9BTK6 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PAGR1Q9BTK6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PAGR1Q9BTK6 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.82■■■□□ 2.36
PAGR1Q9BTK6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.82■■■□□ 2.36
PAGR1Q9BTK6 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PAGR1Q9BTK6 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
PAGR1Q9BTK6 KCNF1-201ENST00000295082 2289 ntAPPRIS P1 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PAGR1Q9BTK6 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PAGR1Q9BTK6 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PAGR1Q9BTK6 KCTD5-202ENST00000564195 774 ntTSL 5 BASIC29.8■■■□□ 2.36
PAGR1Q9BTK6 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
PAGR1Q9BTK6 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
PAGR1Q9BTK6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
PAGR1Q9BTK6 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PAGR1Q9BTK6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.78■■■□□ 2.36
PAGR1Q9BTK6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PAGR1Q9BTK6 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PAGR1Q9BTK6 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PAGR1Q9BTK6 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
PAGR1Q9BTK6 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.77■■■□□ 2.36
PAGR1Q9BTK6 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.35
PAGR1Q9BTK6 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.35
PAGR1Q9BTK6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PAGR1Q9BTK6 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
PAGR1Q9BTK6 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
PAGR1Q9BTK6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PAGR1Q9BTK6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PAGR1Q9BTK6 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC29.72■■■□□ 2.35
PAGR1Q9BTK6 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
PAGR1Q9BTK6 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PAGR1Q9BTK6 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PAGR1Q9BTK6 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
PAGR1Q9BTK6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PAGR1Q9BTK6 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
PAGR1Q9BTK6 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
PAGR1Q9BTK6 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
PAGR1Q9BTK6 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
PAGR1Q9BTK6 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC29.7■■■□□ 2.35
PAGR1Q9BTK6 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC29.7■■■□□ 2.34
PAGR1Q9BTK6 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PAGR1Q9BTK6 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.69■■■□□ 2.34
PAGR1Q9BTK6 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
PAGR1Q9BTK6 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.68■■■□□ 2.34
PAGR1Q9BTK6 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PAGR1Q9BTK6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.67■■■□□ 2.34
PAGR1Q9BTK6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.67■■■□□ 2.34
PAGR1Q9BTK6 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC29.66■■■□□ 2.34
PAGR1Q9BTK6 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.65■■■□□ 2.34
PAGR1Q9BTK6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.65■■■□□ 2.34
PAGR1Q9BTK6 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PAGR1Q9BTK6 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PAGR1Q9BTK6 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.64■■■□□ 2.34
PAGR1Q9BTK6 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.64■■■□□ 2.34
PAGR1Q9BTK6 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PAGR1Q9BTK6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.62■■■□□ 2.33
PAGR1Q9BTK6 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC29.62■■■□□ 2.33
PAGR1Q9BTK6 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PAGR1Q9BTK6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.62■■■□□ 2.33
PAGR1Q9BTK6 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.61■■■□□ 2.33
PAGR1Q9BTK6 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PAGR1Q9BTK6 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PAGR1Q9BTK6 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PAGR1Q9BTK6 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.6■■■□□ 2.33
PAGR1Q9BTK6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PAGR1Q9BTK6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.59■■■□□ 2.33
PAGR1Q9BTK6 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PAGR1Q9BTK6 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.58■■■□□ 2.33
PAGR1Q9BTK6 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PAGR1Q9BTK6 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC29.58■■■□□ 2.33
PAGR1Q9BTK6 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.57■■■□□ 2.32
PAGR1Q9BTK6 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.57■■■□□ 2.32
PAGR1Q9BTK6 LFNG-201ENST00000222725 2377 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.56■■■□□ 2.32
PAGR1Q9BTK6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PAGR1Q9BTK6 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC29.55■■■□□ 2.32
PAGR1Q9BTK6 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.55■■■□□ 2.32
PAGR1Q9BTK6 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC29.55■■■□□ 2.32
PAGR1Q9BTK6 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC29.55■■■□□ 2.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.8 ms