Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSW2

CRACR2A, EF-hand calcium-binding domain-containing protein 4B, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRACR2AQ9BSW2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
CRACR2AQ9BSW2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRACR2AQ9BSW2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRACR2AQ9BSW2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
CRACR2AQ9BSW2 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRACR2AQ9BSW2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRACR2AQ9BSW2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRACR2AQ9BSW2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
CRACR2AQ9BSW2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRACR2AQ9BSW2 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRACR2AQ9BSW2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
CRACR2AQ9BSW2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CRACR2AQ9BSW2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRACR2AQ9BSW2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRACR2AQ9BSW2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CRACR2AQ9BSW2 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRACR2AQ9BSW2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CRACR2AQ9BSW2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRACR2AQ9BSW2 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRACR2AQ9BSW2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CRACR2AQ9BSW2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRACR2AQ9BSW2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRACR2AQ9BSW2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CRACR2AQ9BSW2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CRACR2AQ9BSW2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CRACR2AQ9BSW2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CRACR2AQ9BSW2 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRACR2AQ9BSW2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
CRACR2AQ9BSW2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
CRACR2AQ9BSW2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRACR2AQ9BSW2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRACR2AQ9BSW2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
CRACR2AQ9BSW2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRACR2AQ9BSW2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRACR2AQ9BSW2 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
CRACR2AQ9BSW2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRACR2AQ9BSW2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRACR2AQ9BSW2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
CRACR2AQ9BSW2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRACR2AQ9BSW2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRACR2AQ9BSW2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRACR2AQ9BSW2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRACR2AQ9BSW2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRACR2AQ9BSW2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRACR2AQ9BSW2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRACR2AQ9BSW2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.86■■■□□ 2.05
CRACR2AQ9BSW2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRACR2AQ9BSW2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRACR2AQ9BSW2 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRACR2AQ9BSW2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRACR2AQ9BSW2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
CRACR2AQ9BSW2 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
CRACR2AQ9BSW2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.83■■■□□ 2.05
CRACR2AQ9BSW2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
CRACR2AQ9BSW2 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.83■■■□□ 2.04
CRACR2AQ9BSW2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRACR2AQ9BSW2 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRACR2AQ9BSW2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRACR2AQ9BSW2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRACR2AQ9BSW2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRACR2AQ9BSW2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
CRACR2AQ9BSW2 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRACR2AQ9BSW2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRACR2AQ9BSW2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
CRACR2AQ9BSW2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
CRACR2AQ9BSW2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
CRACR2AQ9BSW2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
CRACR2AQ9BSW2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRACR2AQ9BSW2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRACR2AQ9BSW2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
CRACR2AQ9BSW2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
CRACR2AQ9BSW2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRACR2AQ9BSW2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRACR2AQ9BSW2 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRACR2AQ9BSW2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRACR2AQ9BSW2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRACR2AQ9BSW2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
CRACR2AQ9BSW2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRACR2AQ9BSW2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
CRACR2AQ9BSW2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRACR2AQ9BSW2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC27.75■■■□□ 2.03
CRACR2AQ9BSW2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
CRACR2AQ9BSW2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRACR2AQ9BSW2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRACR2AQ9BSW2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRACR2AQ9BSW2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRACR2AQ9BSW2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRACR2AQ9BSW2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.73■■■□□ 2.03
CRACR2AQ9BSW2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRACR2AQ9BSW2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.73■■■□□ 2.03
CRACR2AQ9BSW2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRACR2AQ9BSW2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
CRACR2AQ9BSW2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.03
CRACR2AQ9BSW2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC27.69■■■□□ 2.02
CRACR2AQ9BSW2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRACR2AQ9BSW2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRACR2AQ9BSW2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRACR2AQ9BSW2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
CRACR2AQ9BSW2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
CRACR2AQ9BSW2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC27.67■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms