Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSE2

TMEM79, Transmembrane protein 79, humanhuman

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM79Q9BSE2 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
TMEM79Q9BSE2 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM79Q9BSE2 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM79Q9BSE2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM79Q9BSE2 CAPNS1-217ENST00000629983 799 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM79Q9BSE2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
TMEM79Q9BSE2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
TMEM79Q9BSE2 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM79Q9BSE2 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM79Q9BSE2 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM79Q9BSE2 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM79Q9BSE2 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM79Q9BSE2 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
TMEM79Q9BSE2 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM79Q9BSE2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM79Q9BSE2 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM79Q9BSE2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM79Q9BSE2 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM79Q9BSE2 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
TMEM79Q9BSE2 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM79Q9BSE2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM79Q9BSE2 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
TMEM79Q9BSE2 ARMC10-205ENST00000428183 2445 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
TMEM79Q9BSE2 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM79Q9BSE2 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM79Q9BSE2 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM79Q9BSE2 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
TMEM79Q9BSE2 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM79Q9BSE2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
TMEM79Q9BSE2 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM79Q9BSE2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
TMEM79Q9BSE2 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
TMEM79Q9BSE2 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM79Q9BSE2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM79Q9BSE2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM79Q9BSE2 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
TMEM79Q9BSE2 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM79Q9BSE2 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM79Q9BSE2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
TMEM79Q9BSE2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM79Q9BSE2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM79Q9BSE2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM79Q9BSE2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM79Q9BSE2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM79Q9BSE2 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
TMEM79Q9BSE2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM79Q9BSE2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM79Q9BSE2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM79Q9BSE2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM79Q9BSE2 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC24.99■■□□□ 1.59
TMEM79Q9BSE2 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM79Q9BSE2 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
TMEM79Q9BSE2 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM79Q9BSE2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM79Q9BSE2 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM79Q9BSE2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
TMEM79Q9BSE2 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM79Q9BSE2 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM79Q9BSE2 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM79Q9BSE2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM79Q9BSE2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
TMEM79Q9BSE2 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
TMEM79Q9BSE2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM79Q9BSE2 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
TMEM79Q9BSE2 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM79Q9BSE2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM79Q9BSE2 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM79Q9BSE2 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM79Q9BSE2 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM79Q9BSE2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
TMEM79Q9BSE2 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14 ms