Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQI6

SLF1, SMC5-SMC6 complex localization factor protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,058 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLF1Q9BQI6 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.95■■■□□ 2.38
SLF1Q9BQI6 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLF1Q9BQI6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLF1Q9BQI6 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLF1Q9BQI6 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLF1Q9BQI6 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLF1Q9BQI6 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLF1Q9BQI6 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLF1Q9BQI6 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLF1Q9BQI6 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLF1Q9BQI6 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLF1Q9BQI6 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLF1Q9BQI6 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLF1Q9BQI6 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLF1Q9BQI6 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLF1Q9BQI6 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.94■■■□□ 2.38
SLF1Q9BQI6 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLF1Q9BQI6 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLF1Q9BQI6 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.93■■■□□ 2.38
SLF1Q9BQI6 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLF1Q9BQI6 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC29.92■■■□□ 2.38
SLF1Q9BQI6 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLF1Q9BQI6 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLF1Q9BQI6 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.91■■■□□ 2.38
SLF1Q9BQI6 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLF1Q9BQI6 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC29.9■■■□□ 2.38
SLF1Q9BQI6 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.89■■■□□ 2.38
SLF1Q9BQI6 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLF1Q9BQI6 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLF1Q9BQI6 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLF1Q9BQI6 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC29.88■■■□□ 2.37
SLF1Q9BQI6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLF1Q9BQI6 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLF1Q9BQI6 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC29.87■■■□□ 2.37
SLF1Q9BQI6 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.86■■■□□ 2.37
SLF1Q9BQI6 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLF1Q9BQI6 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC29.85■■■□□ 2.37
SLF1Q9BQI6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLF1Q9BQI6 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.84■■■□□ 2.37
SLF1Q9BQI6 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLF1Q9BQI6 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLF1Q9BQI6 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLF1Q9BQI6 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLF1Q9BQI6 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLF1Q9BQI6 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC29.83■■■□□ 2.37
SLF1Q9BQI6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.82■■■□□ 2.36
SLF1Q9BQI6 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLF1Q9BQI6 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.81■■■□□ 2.36
SLF1Q9BQI6 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.8■■■□□ 2.36
SLF1Q9BQI6 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC29.79■■■□□ 2.36
SLF1Q9BQI6 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLF1Q9BQI6 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLF1Q9BQI6 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLF1Q9BQI6 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLF1Q9BQI6 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.79■■■□□ 2.36
SLF1Q9BQI6 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLF1Q9BQI6 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLF1Q9BQI6 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.78■■■□□ 2.36
SLF1Q9BQI6 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLF1Q9BQI6 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLF1Q9BQI6 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC29.78■■■□□ 2.36
SLF1Q9BQI6 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLF1Q9BQI6 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLF1Q9BQI6 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC29.77■■■□□ 2.36
SLF1Q9BQI6 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.76■■■□□ 2.36
SLF1Q9BQI6 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.76■■■□□ 2.36
SLF1Q9BQI6 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC29.76■■■□□ 2.36
SLF1Q9BQI6 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLF1Q9BQI6 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLF1Q9BQI6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.75■■■□□ 2.35
SLF1Q9BQI6 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SLF1Q9BQI6 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC29.74■■■□□ 2.35
SLF1Q9BQI6 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLF1Q9BQI6 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.74■■■□□ 2.35
SLF1Q9BQI6 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLF1Q9BQI6 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLF1Q9BQI6 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC29.73■■■□□ 2.35
SLF1Q9BQI6 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLF1Q9BQI6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLF1Q9BQI6 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLF1Q9BQI6 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLF1Q9BQI6 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLF1Q9BQI6 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLF1Q9BQI6 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.72■■■□□ 2.35
SLF1Q9BQI6 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLF1Q9BQI6 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLF1Q9BQI6 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC29.71■■■□□ 2.35
SLF1Q9BQI6 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.71■■■□□ 2.35
SLF1Q9BQI6 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLF1Q9BQI6 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.7■■■□□ 2.35
SLF1Q9BQI6 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLF1Q9BQI6 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLF1Q9BQI6 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLF1Q9BQI6 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.69■■■□□ 2.34
SLF1Q9BQI6 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLF1Q9BQI6 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLF1Q9BQI6 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLF1Q9BQI6 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC29.68■■■□□ 2.34
SLF1Q9BQI6 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
SLF1Q9BQI6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.67■■■□□ 2.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 103 ms