Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD3

KXD1, KxDL motif-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KXD1Q9BQD3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC26.78■■□□□ 1.88
KXD1Q9BQD3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KXD1Q9BQD3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KXD1Q9BQD3 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
KXD1Q9BQD3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KXD1Q9BQD3 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KXD1Q9BQD3 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KXD1Q9BQD3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
KXD1Q9BQD3 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
KXD1Q9BQD3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
KXD1Q9BQD3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.76■■□□□ 1.87
KXD1Q9BQD3 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC26.75■■□□□ 1.87
KXD1Q9BQD3 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
KXD1Q9BQD3 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
KXD1Q9BQD3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KXD1Q9BQD3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KXD1Q9BQD3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
KXD1Q9BQD3 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.72■■□□□ 1.87
KXD1Q9BQD3 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KXD1Q9BQD3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KXD1Q9BQD3 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
KXD1Q9BQD3 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KXD1Q9BQD3 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
KXD1Q9BQD3 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
KXD1Q9BQD3 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
KXD1Q9BQD3 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KXD1Q9BQD3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KXD1Q9BQD3 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
KXD1Q9BQD3 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
KXD1Q9BQD3 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
KXD1Q9BQD3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
KXD1Q9BQD3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KXD1Q9BQD3 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC26.68■■□□□ 1.86
KXD1Q9BQD3 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KXD1Q9BQD3 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
KXD1Q9BQD3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
KXD1Q9BQD3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC26.66■■□□□ 1.86
KXD1Q9BQD3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
KXD1Q9BQD3 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
KXD1Q9BQD3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
KXD1Q9BQD3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
KXD1Q9BQD3 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KXD1Q9BQD3 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KXD1Q9BQD3 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KXD1Q9BQD3 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KXD1Q9BQD3 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
KXD1Q9BQD3 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KXD1Q9BQD3 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KXD1Q9BQD3 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.61■■□□□ 1.85
KXD1Q9BQD3 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
KXD1Q9BQD3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
KXD1Q9BQD3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KXD1Q9BQD3 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
KXD1Q9BQD3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
KXD1Q9BQD3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
KXD1Q9BQD3 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
KXD1Q9BQD3 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KXD1Q9BQD3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KXD1Q9BQD3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
KXD1Q9BQD3 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC26.57■■□□□ 1.84
KXD1Q9BQD3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KXD1Q9BQD3 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KXD1Q9BQD3 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
KXD1Q9BQD3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
KXD1Q9BQD3 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
KXD1Q9BQD3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KXD1Q9BQD3 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
KXD1Q9BQD3 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
KXD1Q9BQD3 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
KXD1Q9BQD3 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
KXD1Q9BQD3 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KXD1Q9BQD3 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
KXD1Q9BQD3 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KXD1Q9BQD3 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KXD1Q9BQD3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
KXD1Q9BQD3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
KXD1Q9BQD3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
KXD1Q9BQD3 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KXD1Q9BQD3 COL13A1-212ENST00000520133 1833 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
KXD1Q9BQD3 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
KXD1Q9BQD3 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
KXD1Q9BQD3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
KXD1Q9BQD3 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KXD1Q9BQD3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
KXD1Q9BQD3 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KXD1Q9BQD3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KXD1Q9BQD3 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KXD1Q9BQD3 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KXD1Q9BQD3 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KXD1Q9BQD3 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
KXD1Q9BQD3 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KXD1Q9BQD3 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
KXD1Q9BQD3 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC26.48■■□□□ 1.83
KXD1Q9BQD3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
KXD1Q9BQD3 FADS3-201ENST00000278829 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KXD1Q9BQD3 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KXD1Q9BQD3 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
KXD1Q9BQD3 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
KXD1Q9BQD3 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
KXD1Q9BQD3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms