Protein–RNA interactions for Protein: Q99966

CITED1, Cbp/p300-interacting transactivator 1, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED1Q99966 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
CITED1Q99966 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
CITED1Q99966 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
CITED1Q99966 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
CITED1Q99966 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
CITED1Q99966 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
CITED1Q99966 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
CITED1Q99966 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
CITED1Q99966 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
CITED1Q99966 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CITED1Q99966 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
CITED1Q99966 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
CITED1Q99966 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CITED1Q99966 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CITED1Q99966 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CITED1Q99966 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CITED1Q99966 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CITED1Q99966 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
CITED1Q99966 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
CITED1Q99966 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CITED1Q99966 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CITED1Q99966 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
CITED1Q99966 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
CITED1Q99966 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CITED1Q99966 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
CITED1Q99966 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
CITED1Q99966 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
CITED1Q99966 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
CITED1Q99966 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
CITED1Q99966 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CITED1Q99966 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
CITED1Q99966 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC20■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
CITED1Q99966 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC19.9■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
CITED1Q99966 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
CITED1Q99966 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9 ms