Protein–RNA interactions for Protein: Q99766

ATP5S, ATP synthase subunit s, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5SQ99766 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP5SQ99766 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP5SQ99766 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
ATP5SQ99766 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP5SQ99766 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP5SQ99766 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
ATP5SQ99766 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
ATP5SQ99766 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP5SQ99766 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP5SQ99766 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP5SQ99766 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
ATP5SQ99766 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP5SQ99766 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP5SQ99766 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP5SQ99766 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP5SQ99766 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP5SQ99766 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP5SQ99766 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
ATP5SQ99766 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5SQ99766 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
ATP5SQ99766 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5SQ99766 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
ATP5SQ99766 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5SQ99766 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5SQ99766 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5SQ99766 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
ATP5SQ99766 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5SQ99766 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5SQ99766 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5SQ99766 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
ATP5SQ99766 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5SQ99766 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5SQ99766 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5SQ99766 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
ATP5SQ99766 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5SQ99766 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5SQ99766 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5SQ99766 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5SQ99766 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5SQ99766 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5SQ99766 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
ATP5SQ99766 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
ATP5SQ99766 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5SQ99766 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5SQ99766 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5SQ99766 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
ATP5SQ99766 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5SQ99766 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5SQ99766 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5SQ99766 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5SQ99766 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
ATP5SQ99766 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5SQ99766 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5SQ99766 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5SQ99766 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5SQ99766 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
ATP5SQ99766 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP5SQ99766 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP5SQ99766 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
ATP5SQ99766 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5SQ99766 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5SQ99766 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5SQ99766 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5SQ99766 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5SQ99766 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5SQ99766 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5SQ99766 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
ATP5SQ99766 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
ATP5SQ99766 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.4 ms