Protein–RNA interactions for Protein: Q99638

RAD9A, Cell cycle checkpoint control protein RAD9A, humanhuman

Predictions only

Length 391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD9AQ99638 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAD9AQ99638 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
RAD9AQ99638 MTCP1-202ENST00000369476 2274 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
RAD9AQ99638 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAD9AQ99638 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAD9AQ99638 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAD9AQ99638 OLFM2-201ENST00000264833 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
RAD9AQ99638 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAD9AQ99638 BCL7B-201ENST00000223368 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAD9AQ99638 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
RAD9AQ99638 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAD9AQ99638 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
RAD9AQ99638 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAD9AQ99638 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
RAD9AQ99638 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD9AQ99638 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD9AQ99638 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD9AQ99638 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD9AQ99638 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD9AQ99638 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
RAD9AQ99638 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD9AQ99638 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD9AQ99638 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
RAD9AQ99638 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
RAD9AQ99638 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD9AQ99638 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
RAD9AQ99638 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RAD9AQ99638 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
RAD9AQ99638 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
RAD9AQ99638 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
RAD9AQ99638 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
RAD9AQ99638 GPI-201ENST00000356487 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAD9AQ99638 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
RAD9AQ99638 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
RAD9AQ99638 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
RAD9AQ99638 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
RAD9AQ99638 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAD9AQ99638 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAD9AQ99638 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
RAD9AQ99638 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD9AQ99638 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD9AQ99638 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.84■■■□□ 2.05
RAD9AQ99638 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.83■■■□□ 2.05
RAD9AQ99638 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
RAD9AQ99638 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
RAD9AQ99638 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD9AQ99638 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD9AQ99638 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD9AQ99638 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD9AQ99638 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
RAD9AQ99638 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD9AQ99638 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD9AQ99638 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD9AQ99638 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
RAD9AQ99638 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAD9AQ99638 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
RAD9AQ99638 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
RAD9AQ99638 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAD9AQ99638 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAD9AQ99638 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAD9AQ99638 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAD9AQ99638 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAD9AQ99638 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
RAD9AQ99638 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
RAD9AQ99638 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAD9AQ99638 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
RAD9AQ99638 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAD9AQ99638 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAD9AQ99638 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.76■■■□□ 2.03
RAD9AQ99638 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RAD9AQ99638 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27.75■■■□□ 2.03
RAD9AQ99638 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
RAD9AQ99638 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAD9AQ99638 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.74■■■□□ 2.03
RAD9AQ99638 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAD9AQ99638 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAD9AQ99638 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
RAD9AQ99638 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
RAD9AQ99638 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAD9AQ99638 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAD9AQ99638 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
RAD9AQ99638 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAD9AQ99638 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAD9AQ99638 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.71■■■□□ 2.03
RAD9AQ99638 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAD9AQ99638 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAD9AQ99638 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
RAD9AQ99638 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
RAD9AQ99638 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
RAD9AQ99638 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RAD9AQ99638 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
RAD9AQ99638 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAD9AQ99638 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
RAD9AQ99638 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAD9AQ99638 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAD9AQ99638 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAD9AQ99638 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.68■■■□□ 2.02
RAD9AQ99638 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAD9AQ99638 IFNGR2-201ENST00000290219 2221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
RAD9AQ99638 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms