Protein–RNA interactions for Protein: Q99523

SORT1, Sortilin, humanhuman

Predictions only

Length 831 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORT1Q99523 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
SORT1Q99523 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
SORT1Q99523 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
SORT1Q99523 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SORT1Q99523 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SORT1Q99523 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
SORT1Q99523 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
SORT1Q99523 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SORT1Q99523 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
SORT1Q99523 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SORT1Q99523 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SORT1Q99523 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC25.11■■□□□ 1.61
SORT1Q99523 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SORT1Q99523 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SORT1Q99523 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SORT1Q99523 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SORT1Q99523 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
SORT1Q99523 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
SORT1Q99523 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SORT1Q99523 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SORT1Q99523 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SORT1Q99523 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SORT1Q99523 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
SORT1Q99523 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SORT1Q99523 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SORT1Q99523 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
SORT1Q99523 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SORT1Q99523 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SORT1Q99523 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SORT1Q99523 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
SORT1Q99523 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SORT1Q99523 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
SORT1Q99523 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SORT1Q99523 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SORT1Q99523 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
SORT1Q99523 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SORT1Q99523 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
SORT1Q99523 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SORT1Q99523 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SORT1Q99523 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SORT1Q99523 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SORT1Q99523 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SORT1Q99523 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SORT1Q99523 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SORT1Q99523 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
SORT1Q99523 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
SORT1Q99523 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
SORT1Q99523 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
SORT1Q99523 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SORT1Q99523 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SORT1Q99523 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
SORT1Q99523 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SORT1Q99523 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SORT1Q99523 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SORT1Q99523 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
SORT1Q99523 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SORT1Q99523 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
SORT1Q99523 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC25■■□□□ 1.59
SORT1Q99523 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SORT1Q99523 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SORT1Q99523 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORT1Q99523 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORT1Q99523 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SORT1Q99523 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SORT1Q99523 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SORT1Q99523 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SORT1Q99523 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SORT1Q99523 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SORT1Q99523 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SORT1Q99523 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
SORT1Q99523 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SORT1Q99523 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
SORT1Q99523 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SORT1Q99523 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SORT1Q99523 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
SORT1Q99523 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SORT1Q99523 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
SORT1Q99523 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SORT1Q99523 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SORT1Q99523 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SORT1Q99523 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SORT1Q99523 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SORT1Q99523 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SORT1Q99523 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SORT1Q99523 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SORT1Q99523 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SORT1Q99523 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SORT1Q99523 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SORT1Q99523 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SORT1Q99523 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SORT1Q99523 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
SORT1Q99523 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SORT1Q99523 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SORT1Q99523 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SORT1Q99523 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
SORT1Q99523 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SORT1Q99523 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SORT1Q99523 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SORT1Q99523 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
SORT1Q99523 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 9.7 ms