Protein–RNA interactions for Protein: Q96S94

CCNL2, Cyclin-L2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 520 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNL2Q96S94 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNL2Q96S94 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNL2Q96S94 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNL2Q96S94 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNL2Q96S94 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CCNL2Q96S94 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNL2Q96S94 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CCNL2Q96S94 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNL2Q96S94 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNL2Q96S94 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNL2Q96S94 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNL2Q96S94 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CCNL2Q96S94 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNL2Q96S94 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CCNL2Q96S94 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNL2Q96S94 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNL2Q96S94 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CCNL2Q96S94 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNL2Q96S94 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CCNL2Q96S94 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CCNL2Q96S94 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
CCNL2Q96S94 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.51
CCNL2Q96S94 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNL2Q96S94 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNL2Q96S94 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
CCNL2Q96S94 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNL2Q96S94 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNL2Q96S94 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CCNL2Q96S94 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNL2Q96S94 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CCNL2Q96S94 JMJD8-216ENST00000609261 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNL2Q96S94 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNL2Q96S94 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNL2Q96S94 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNL2Q96S94 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CCNL2Q96S94 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNL2Q96S94 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNL2Q96S94 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNL2Q96S94 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CCNL2Q96S94 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNL2Q96S94 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNL2Q96S94 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNL2Q96S94 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNL2Q96S94 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNL2Q96S94 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CCNL2Q96S94 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
CCNL2Q96S94 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNL2Q96S94 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNL2Q96S94 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNL2Q96S94 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNL2Q96S94 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CCNL2Q96S94 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNL2Q96S94 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CCNL2Q96S94 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNL2Q96S94 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNL2Q96S94 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNL2Q96S94 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNL2Q96S94 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNL2Q96S94 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CCNL2Q96S94 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNL2Q96S94 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CCNL2Q96S94 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNL2Q96S94 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CCNL2Q96S94 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL2Q96S94 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL2Q96S94 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL2Q96S94 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL2Q96S94 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL2Q96S94 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL2Q96S94 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CCNL2Q96S94 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNL2Q96S94 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CCNL2Q96S94 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNL2Q96S94 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CCNL2Q96S94 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNL2Q96S94 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNL2Q96S94 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNL2Q96S94 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNL2Q96S94 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CCNL2Q96S94 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNL2Q96S94 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNL2Q96S94 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNL2Q96S94 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNL2Q96S94 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNL2Q96S94 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
CCNL2Q96S94 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNL2Q96S94 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
CCNL2Q96S94 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNL2Q96S94 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNL2Q96S94 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.28■■□□□ 1.48
CCNL2Q96S94 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNL2Q96S94 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNL2Q96S94 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNL2Q96S94 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNL2Q96S94 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNL2Q96S94 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
CCNL2Q96S94 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNL2Q96S94 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNL2Q96S94 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
CCNL2Q96S94 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.1 ms