Protein–RNA interactions for Protein: Q96RI1

NR1H4, Bile acid receptor, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR1H4Q96RI1 TCEA2-204ENST00000395053 1733 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1H4Q96RI1 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1H4Q96RI1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1H4Q96RI1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NR1H4Q96RI1 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1H4Q96RI1 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NR1H4Q96RI1 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1H4Q96RI1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NR1H4Q96RI1 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NR1H4Q96RI1 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
NR1H4Q96RI1 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
NR1H4Q96RI1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1H4Q96RI1 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1H4Q96RI1 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1H4Q96RI1 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
NR1H4Q96RI1 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1H4Q96RI1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
NR1H4Q96RI1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1H4Q96RI1 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1H4Q96RI1 GIPC1-201ENST00000345425 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1H4Q96RI1 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1H4Q96RI1 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1H4Q96RI1 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1H4Q96RI1 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
NR1H4Q96RI1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1H4Q96RI1 RASSF7-201ENST00000397582 1731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1H4Q96RI1 AC008738.5-201ENST00000587312 482 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1H4Q96RI1 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
NR1H4Q96RI1 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1H4Q96RI1 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1H4Q96RI1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1H4Q96RI1 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1H4Q96RI1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR1H4Q96RI1 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1H4Q96RI1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1H4Q96RI1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1H4Q96RI1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR1H4Q96RI1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR1H4Q96RI1 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1H4Q96RI1 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1H4Q96RI1 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR1H4Q96RI1 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR1H4Q96RI1 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1H4Q96RI1 PCSK6-218ENST00000619160 3093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1H4Q96RI1 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1H4Q96RI1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR1H4Q96RI1 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1H4Q96RI1 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1H4Q96RI1 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1H4Q96RI1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR1H4Q96RI1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1H4Q96RI1 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1H4Q96RI1 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1H4Q96RI1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR1H4Q96RI1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR1H4Q96RI1 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR1H4Q96RI1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR1H4Q96RI1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1H4Q96RI1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1H4Q96RI1 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1H4Q96RI1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR1H4Q96RI1 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NR1H4Q96RI1 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NR1H4Q96RI1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NR1H4Q96RI1 HAGHL-204ENST00000549114 1820 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
NR1H4Q96RI1 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1H4Q96RI1 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1H4Q96RI1 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1H4Q96RI1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1H4Q96RI1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1H4Q96RI1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR1H4Q96RI1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1H4Q96RI1 DBP-205ENST00000601104 1489 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1H4Q96RI1 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR1H4Q96RI1 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR1H4Q96RI1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR1H4Q96RI1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1H4Q96RI1 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1H4Q96RI1 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1H4Q96RI1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1H4Q96RI1 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR1H4Q96RI1 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1H4Q96RI1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1H4Q96RI1 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR1H4Q96RI1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR1H4Q96RI1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR1H4Q96RI1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR1H4Q96RI1 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR1H4Q96RI1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR1H4Q96RI1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1H4Q96RI1 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1H4Q96RI1 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1H4Q96RI1 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR1H4Q96RI1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1H4Q96RI1 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1H4Q96RI1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR1H4Q96RI1 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1H4Q96RI1 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1H4Q96RI1 CHCHD4-201ENST00000295767 1603 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NR1H4Q96RI1 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.5 ms