Protein–RNA interactions for Protein: Q96QT6

PHF12, PHD finger protein 12, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF12Q96QT6 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF12Q96QT6 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF12Q96QT6 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF12Q96QT6 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF12Q96QT6 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
PHF12Q96QT6 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF12Q96QT6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF12Q96QT6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF12Q96QT6 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF12Q96QT6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
PHF12Q96QT6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF12Q96QT6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF12Q96QT6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF12Q96QT6 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF12Q96QT6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
PHF12Q96QT6 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
PHF12Q96QT6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF12Q96QT6 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF12Q96QT6 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF12Q96QT6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
PHF12Q96QT6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF12Q96QT6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
PHF12Q96QT6 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
PHF12Q96QT6 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF12Q96QT6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF12Q96QT6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF12Q96QT6 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF12Q96QT6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
PHF12Q96QT6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF12Q96QT6 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
PHF12Q96QT6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF12Q96QT6 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF12Q96QT6 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF12Q96QT6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
PHF12Q96QT6 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF12Q96QT6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF12Q96QT6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF12Q96QT6 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF12Q96QT6 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
PHF12Q96QT6 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PHF12Q96QT6 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF12Q96QT6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF12Q96QT6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF12Q96QT6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PHF12Q96QT6 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF12Q96QT6 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF12Q96QT6 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PHF12Q96QT6 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF12Q96QT6 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF12Q96QT6 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF12Q96QT6 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF12Q96QT6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
PHF12Q96QT6 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHF12Q96QT6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHF12Q96QT6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHF12Q96QT6 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
PHF12Q96QT6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 WNT5A-AS1-201ENST00000469484 500 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PHF12Q96QT6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PHF12Q96QT6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms