Protein–RNA interactions for Protein: Q96PF2

TSSK2, Testis-specific serine/threonine-protein kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSSK2Q96PF2 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSSK2Q96PF2 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSSK2Q96PF2 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSSK2Q96PF2 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TSSK2Q96PF2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
TSSK2Q96PF2 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSSK2Q96PF2 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSSK2Q96PF2 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSSK2Q96PF2 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSSK2Q96PF2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TSSK2Q96PF2 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TSSK2Q96PF2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSSK2Q96PF2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSSK2Q96PF2 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSSK2Q96PF2 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TSSK2Q96PF2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSSK2Q96PF2 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TSSK2Q96PF2 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSSK2Q96PF2 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TSSK2Q96PF2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TSSK2Q96PF2 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
TSSK2Q96PF2 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSSK2Q96PF2 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSSK2Q96PF2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSSK2Q96PF2 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSSK2Q96PF2 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSSK2Q96PF2 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
TSSK2Q96PF2 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSSK2Q96PF2 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
TSSK2Q96PF2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSSK2Q96PF2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSSK2Q96PF2 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
TSSK2Q96PF2 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
TSSK2Q96PF2 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSSK2Q96PF2 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
TSSK2Q96PF2 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSSK2Q96PF2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSSK2Q96PF2 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSSK2Q96PF2 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSSK2Q96PF2 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
TSSK2Q96PF2 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
TSSK2Q96PF2 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.2 ms