Protein–RNA interactions for Protein: Q96NE9

FRMD6, FERM domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 622 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMD6Q96NE9 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMD6Q96NE9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
FRMD6Q96NE9 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMD6Q96NE9 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMD6Q96NE9 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMD6Q96NE9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMD6Q96NE9 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMD6Q96NE9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
FRMD6Q96NE9 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
FRMD6Q96NE9 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 CGREF1-203ENST00000402394 1906 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
FRMD6Q96NE9 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
FRMD6Q96NE9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMD6Q96NE9 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
FRMD6Q96NE9 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMD6Q96NE9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMD6Q96NE9 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMD6Q96NE9 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
FRMD6Q96NE9 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMD6Q96NE9 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
FRMD6Q96NE9 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMD6Q96NE9 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMD6Q96NE9 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMD6Q96NE9 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
FRMD6Q96NE9 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
FRMD6Q96NE9 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMD6Q96NE9 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
FRMD6Q96NE9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
FRMD6Q96NE9 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
FRMD6Q96NE9 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.3 ms