Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CPNE2Q96FN4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
CPNE2Q96FN4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
CPNE2Q96FN4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPNE2Q96FN4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPNE2Q96FN4 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPNE2Q96FN4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPNE2Q96FN4 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
CPNE2Q96FN4 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPNE2Q96FN4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPNE2Q96FN4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPNE2Q96FN4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
CPNE2Q96FN4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPNE2Q96FN4 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPNE2Q96FN4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPNE2Q96FN4 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
CPNE2Q96FN4 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPNE2Q96FN4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPNE2Q96FN4 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPNE2Q96FN4 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPNE2Q96FN4 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPNE2Q96FN4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPNE2Q96FN4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
CPNE2Q96FN4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPNE2Q96FN4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPNE2Q96FN4 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPNE2Q96FN4 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
CPNE2Q96FN4 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
CPNE2Q96FN4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC21.87■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
CPNE2Q96FN4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CPNE2Q96FN4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
CPNE2Q96FN4 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC21.83■■□□□ 1.08
CPNE2Q96FN4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPNE2Q96FN4 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
CPNE2Q96FN4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 111.7 ms