Protein–RNA interactions for Protein: Q96CP6

GRAMD1A, GRAM domain-containing protein 1A, humanhuman

Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRAMD1AQ96CP6 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
GRAMD1AQ96CP6 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 CRIP1-201ENST00000330233 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 AVEN-201ENST00000306730 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 MTMR1-214ENST00000542156 1227 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
GRAMD1AQ96CP6 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
GRAMD1AQ96CP6 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
GRAMD1AQ96CP6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRAMD1AQ96CP6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
GRAMD1AQ96CP6 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRAMD1AQ96CP6 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRAMD1AQ96CP6 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
GRAMD1AQ96CP6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRAMD1AQ96CP6 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRAMD1AQ96CP6 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRAMD1AQ96CP6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRAMD1AQ96CP6 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
GRAMD1AQ96CP6 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRAMD1AQ96CP6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRAMD1AQ96CP6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
GRAMD1AQ96CP6 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.75
GRAMD1AQ96CP6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRAMD1AQ96CP6 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
GRAMD1AQ96CP6 RNF150-204ENST00000507500 1530 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRAMD1AQ96CP6 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRAMD1AQ96CP6 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRAMD1AQ96CP6 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRAMD1AQ96CP6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.94■■□□□ 1.74
GRAMD1AQ96CP6 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRAMD1AQ96CP6 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRAMD1AQ96CP6 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
GRAMD1AQ96CP6 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRAMD1AQ96CP6 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRAMD1AQ96CP6 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
GRAMD1AQ96CP6 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
GRAMD1AQ96CP6 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRAMD1AQ96CP6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
GRAMD1AQ96CP6 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRAMD1AQ96CP6 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
GRAMD1AQ96CP6 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRAMD1AQ96CP6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
GRAMD1AQ96CP6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRAMD1AQ96CP6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRAMD1AQ96CP6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRAMD1AQ96CP6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
GRAMD1AQ96CP6 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GRAMD1AQ96CP6 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC25.88■■□□□ 1.73
GRAMD1AQ96CP6 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
GRAMD1AQ96CP6 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRAMD1AQ96CP6 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRAMD1AQ96CP6 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
GRAMD1AQ96CP6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRAMD1AQ96CP6 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRAMD1AQ96CP6 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
GRAMD1AQ96CP6 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRAMD1AQ96CP6 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRAMD1AQ96CP6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRAMD1AQ96CP6 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRAMD1AQ96CP6 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
GRAMD1AQ96CP6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRAMD1AQ96CP6 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRAMD1AQ96CP6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
GRAMD1AQ96CP6 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
GRAMD1AQ96CP6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRAMD1AQ96CP6 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRAMD1AQ96CP6 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
GRAMD1AQ96CP6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRAMD1AQ96CP6 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRAMD1AQ96CP6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.81■■□□□ 1.72
GRAMD1AQ96CP6 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
GRAMD1AQ96CP6 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.3 ms