Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 NPAS3-206ENST00000548645 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 GRK2-204ENST00000526285 1458 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 EBPL-203ENST00000378270 579 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 FOXA2-201ENST00000377115 2401 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
TMIGD2Q96BF3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMIGD2Q96BF3 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMIGD2Q96BF3 AC243773.2-204ENST00000621428 1462 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMIGD2Q96BF3 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMIGD2Q96BF3 GLRX5-201ENST00000331334 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMIGD2Q96BF3 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMIGD2Q96BF3 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
TMIGD2Q96BF3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMIGD2Q96BF3 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMIGD2Q96BF3 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
TMIGD2Q96BF3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMIGD2Q96BF3 GUSB-202ENST00000421103 1742 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMIGD2Q96BF3 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMIGD2Q96BF3 AARD-201ENST00000378279 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMIGD2Q96BF3 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMIGD2Q96BF3 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMIGD2Q96BF3 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
TMIGD2Q96BF3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMIGD2Q96BF3 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMIGD2Q96BF3 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMIGD2Q96BF3 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMIGD2Q96BF3 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMIGD2Q96BF3 IRX4-202ENST00000505790 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
TMIGD2Q96BF3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMIGD2Q96BF3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
TMIGD2Q96BF3 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
TMIGD2Q96BF3 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMIGD2Q96BF3 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
TMIGD2Q96BF3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMIGD2Q96BF3 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMIGD2Q96BF3 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMIGD2Q96BF3 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMIGD2Q96BF3 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMIGD2Q96BF3 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
TMIGD2Q96BF3 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMIGD2Q96BF3 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMIGD2Q96BF3 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMIGD2Q96BF3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TMIGD2Q96BF3 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMIGD2Q96BF3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMIGD2Q96BF3 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TMIGD2Q96BF3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMIGD2Q96BF3 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMIGD2Q96BF3 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMIGD2Q96BF3 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMIGD2Q96BF3 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMIGD2Q96BF3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TMIGD2Q96BF3 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMIGD2Q96BF3 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMIGD2Q96BF3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMIGD2Q96BF3 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMIGD2Q96BF3 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
TMIGD2Q96BF3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMIGD2Q96BF3 ATP5G2-208ENST00000552242 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMIGD2Q96BF3 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TMIGD2Q96BF3 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMIGD2Q96BF3 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TMIGD2Q96BF3 KCNQ5-204ENST00000370392 1469 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMIGD2Q96BF3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMIGD2Q96BF3 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TMIGD2Q96BF3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TMIGD2Q96BF3 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMIGD2Q96BF3 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TMIGD2Q96BF3 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms