Protein–RNA interactions for Protein: Q969I6

SLC38A4, Sodium-coupled neutral amino acid transporter 4, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC38A4Q969I6 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC23.7■■□□□ 1.39
SLC38A4Q969I6 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC38A4Q969I6 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
SLC38A4Q969I6 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC38A4Q969I6 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
SLC38A4Q969I6 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC38A4Q969I6 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC38A4Q969I6 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC38A4Q969I6 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SLC38A4Q969I6 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC38A4Q969I6 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC38A4Q969I6 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC38A4Q969I6 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC38A4Q969I6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SLC38A4Q969I6 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A4Q969I6 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A4Q969I6 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A4Q969I6 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A4Q969I6 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A4Q969I6 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SLC38A4Q969I6 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A4Q969I6 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A4Q969I6 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A4Q969I6 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SLC38A4Q969I6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC38A4Q969I6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC38A4Q969I6 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.38
SLC38A4Q969I6 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
SLC38A4Q969I6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
SLC38A4Q969I6 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A4Q969I6 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
SLC38A4Q969I6 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.9 ms