Protein–RNA interactions for Protein: Q92982

NINJ1, Ninjurin-1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NINJ1Q92982 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 TPRA1-201ENST00000296210 1725 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
NINJ1Q92982 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINJ1Q92982 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINJ1Q92982 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
NINJ1Q92982 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINJ1Q92982 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINJ1Q92982 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
NINJ1Q92982 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
NINJ1Q92982 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINJ1Q92982 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINJ1Q92982 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
NINJ1Q92982 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINJ1Q92982 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINJ1Q92982 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
NINJ1Q92982 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
NINJ1Q92982 CNIH2-203ENST00000528852 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
NINJ1Q92982 TPM2-203ENST00000378292 2147 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
NINJ1Q92982 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NINJ1Q92982 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
NINJ1Q92982 GLTP-201ENST00000318348 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
NINJ1Q92982 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
NINJ1Q92982 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NINJ1Q92982 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NINJ1Q92982 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NINJ1Q92982 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NINJ1Q92982 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
NINJ1Q92982 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NINJ1Q92982 ABCB10P1-201ENST00000614297 2181 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
NINJ1Q92982 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
NINJ1Q92982 AGAP3-216ENST00000479901 1881 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NINJ1Q92982 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NINJ1Q92982 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NINJ1Q92982 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
NINJ1Q92982 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
NINJ1Q92982 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NINJ1Q92982 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
NINJ1Q92982 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 FOXA2-202ENST00000419308 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 LIME1-206ENST00000487026 805 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
NINJ1Q92982 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NINJ1Q92982 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
NINJ1Q92982 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
NINJ1Q92982 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINJ1Q92982 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINJ1Q92982 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINJ1Q92982 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINJ1Q92982 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINJ1Q92982 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINJ1Q92982 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
NINJ1Q92982 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NINJ1Q92982 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
NINJ1Q92982 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
NINJ1Q92982 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NINJ1Q92982 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
NINJ1Q92982 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.4 ms