Protein–RNA interactions for Protein: Q92890

UFD1, Ubiquitin recognition factor in ER-associated degradation protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UFD1Q92890 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UFD1Q92890 ZCCHC2-201ENST00000269499 5959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UFD1Q92890 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UFD1Q92890 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
UFD1Q92890 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
UFD1Q92890 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
UFD1Q92890 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UFD1Q92890 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UFD1Q92890 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
UFD1Q92890 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UFD1Q92890 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
UFD1Q92890 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UFD1Q92890 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UFD1Q92890 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UFD1Q92890 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
UFD1Q92890 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.23
UFD1Q92890 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
UFD1Q92890 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UFD1Q92890 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
UFD1Q92890 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UFD1Q92890 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UFD1Q92890 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
UFD1Q92890 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
UFD1Q92890 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UFD1Q92890 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
UFD1Q92890 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
UFD1Q92890 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UFD1Q92890 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UFD1Q92890 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
UFD1Q92890 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UFD1Q92890 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
UFD1Q92890 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UFD1Q92890 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UFD1Q92890 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
UFD1Q92890 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
UFD1Q92890 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UFD1Q92890 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UFD1Q92890 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UFD1Q92890 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
UFD1Q92890 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UFD1Q92890 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
UFD1Q92890 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
UFD1Q92890 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
UFD1Q92890 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
UFD1Q92890 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
UFD1Q92890 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFD1Q92890 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFD1Q92890 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
UFD1Q92890 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFD1Q92890 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFD1Q92890 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
UFD1Q92890 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFD1Q92890 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFD1Q92890 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
UFD1Q92890 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFD1Q92890 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFD1Q92890 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
UFD1Q92890 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFD1Q92890 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFD1Q92890 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFD1Q92890 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
UFD1Q92890 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
UFD1Q92890 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.22
UFD1Q92890 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UFD1Q92890 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UFD1Q92890 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UFD1Q92890 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
UFD1Q92890 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFD1Q92890 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFD1Q92890 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFD1Q92890 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
UFD1Q92890 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
UFD1Q92890 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFD1Q92890 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFD1Q92890 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFD1Q92890 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFD1Q92890 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFD1Q92890 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
UFD1Q92890 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFD1Q92890 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFD1Q92890 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
UFD1Q92890 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFD1Q92890 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFD1Q92890 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFD1Q92890 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
UFD1Q92890 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFD1Q92890 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFD1Q92890 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFD1Q92890 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFD1Q92890 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFD1Q92890 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
UFD1Q92890 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
UFD1Q92890 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.1 ms