Protein–RNA interactions for Protein: Q92854

SEMA4D, Semaphorin-4D, humanhuman

Predictions only

Length 862 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4DQ92854 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA4DQ92854 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA4DQ92854 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA4DQ92854 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA4DQ92854 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
SEMA4DQ92854 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA4DQ92854 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA4DQ92854 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA4DQ92854 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.72■■■□□ 2.03
SEMA4DQ92854 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA4DQ92854 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA4DQ92854 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA4DQ92854 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
SEMA4DQ92854 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SEMA4DQ92854 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
SEMA4DQ92854 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 PLSCR3-209ENST00000574401 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC27.67■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.66■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.02
SEMA4DQ92854 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.64■■■□□ 2.01
SEMA4DQ92854 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.64■■■□□ 2.01
SEMA4DQ92854 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA4DQ92854 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA4DQ92854 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
SEMA4DQ92854 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA4DQ92854 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC27.62■■■□□ 2.01
SEMA4DQ92854 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
SEMA4DQ92854 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEMA4DQ92854 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEMA4DQ92854 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEMA4DQ92854 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEMA4DQ92854 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
SEMA4DQ92854 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
SEMA4DQ92854 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA4DQ92854 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA4DQ92854 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA4DQ92854 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA4DQ92854 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
SEMA4DQ92854 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
SEMA4DQ92854 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
SEMA4DQ92854 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SEMA4DQ92854 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
SEMA4DQ92854 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
SEMA4DQ92854 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEMA4DQ92854 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
SEMA4DQ92854 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
SEMA4DQ92854 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA4DQ92854 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA4DQ92854 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
SEMA4DQ92854 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■■□□ 2
SEMA4DQ92854 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEMA4DQ92854 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEMA4DQ92854 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEMA4DQ92854 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
SEMA4DQ92854 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEMA4DQ92854 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEMA4DQ92854 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC27.5■■□□□ 1.99
SEMA4DQ92854 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEMA4DQ92854 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEMA4DQ92854 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
SEMA4DQ92854 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA4DQ92854 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA4DQ92854 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
SEMA4DQ92854 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.6 ms