Protein–RNA interactions for Protein: Q92729

PTPRU, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase U, humanhuman

Predictions only

Length 1,446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRUQ92729 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC36.76■■■■□ 3.47
PTPRUQ92729 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.76■■■■□ 3.47
PTPRUQ92729 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC36.76■■■■□ 3.47
PTPRUQ92729 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC36.75■■■■□ 3.47
PTPRUQ92729 GATA6-202ENST00000581694 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTPRUQ92729 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTPRUQ92729 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTPRUQ92729 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTPRUQ92729 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.75■■■■□ 3.47
PTPRUQ92729 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC36.74■■■■□ 3.47
PTPRUQ92729 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC36.73■■■■□ 3.47
PTPRUQ92729 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.72■■■■□ 3.47
PTPRUQ92729 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC36.72■■■■□ 3.47
PTPRUQ92729 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC36.72■■■■□ 3.47
PTPRUQ92729 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.71■■■■□ 3.47
PTPRUQ92729 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PTPRUQ92729 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.7■■■■□ 3.47
PTPRUQ92729 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.47
PTPRUQ92729 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC36.7■■■■□ 3.46
PTPRUQ92729 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.69■■■■□ 3.46
PTPRUQ92729 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PTPRUQ92729 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC36.68■■■■□ 3.46
PTPRUQ92729 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC36.68■■■■□ 3.46
PTPRUQ92729 FSD1L-204ENST00000469022 1836 ntTSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTPRUQ92729 SIAH1-203ENST00000394725 2147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTPRUQ92729 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC36.67■■■■□ 3.46
PTPRUQ92729 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.66■■■■□ 3.46
PTPRUQ92729 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PTPRUQ92729 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC36.65■■■■□ 3.46
PTPRUQ92729 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.65■■■■□ 3.46
PTPRUQ92729 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC36.65■■■■□ 3.46
PTPRUQ92729 TMEM229A-201ENST00000455783 2108 ntAPPRIS P1 BASIC36.64■■■■□ 3.46
PTPRUQ92729 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PTPRUQ92729 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PTPRUQ92729 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PTPRUQ92729 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.64■■■■□ 3.46
PTPRUQ92729 CISD3-204ENST00000613478 2074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PTPRUQ92729 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC36.63■■■■□ 3.45
PTPRUQ92729 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC36.62■■■■□ 3.45
PTPRUQ92729 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
PTPRUQ92729 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC36.61■■■■□ 3.45
PTPRUQ92729 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC36.61■■■■□ 3.45
PTPRUQ92729 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PTPRUQ92729 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
PTPRUQ92729 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PTPRUQ92729 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
PTPRUQ92729 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PTPRUQ92729 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
PTPRUQ92729 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
PTPRUQ92729 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PTPRUQ92729 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
PTPRUQ92729 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC36.57■■■■□ 3.44
PTPRUQ92729 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC36.56■■■■□ 3.44
PTPRUQ92729 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PTPRUQ92729 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PTPRUQ92729 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PTPRUQ92729 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC36.56■■■■□ 3.44
PTPRUQ92729 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC36.54■■■■□ 3.44
PTPRUQ92729 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
PTPRUQ92729 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PTPRUQ92729 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.53■■■■□ 3.44
PTPRUQ92729 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC36.52■■■■□ 3.44
PTPRUQ92729 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PTPRUQ92729 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.44
PTPRUQ92729 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC36.51■■■■□ 3.43
PTPRUQ92729 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRUQ92729 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRUQ92729 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC36.49■■■■□ 3.43
PTPRUQ92729 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
PTPRUQ92729 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PTPRUQ92729 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
PTPRUQ92729 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC36.44■■■■□ 3.42
PTPRUQ92729 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PTPRUQ92729 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
PTPRUQ92729 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PTPRUQ92729 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
PTPRUQ92729 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
PTPRUQ92729 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
PTPRUQ92729 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC36.42■■■■□ 3.42
PTPRUQ92729 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
PTPRUQ92729 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
PTPRUQ92729 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PTPRUQ92729 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
PTPRUQ92729 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
PTPRUQ92729 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC36.41■■■■□ 3.42
PTPRUQ92729 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PTPRUQ92729 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC36.41■■■■□ 3.42
PTPRUQ92729 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PTPRUQ92729 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC36.4■■■■□ 3.42
PTPRUQ92729 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PTPRUQ92729 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
PTPRUQ92729 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PTPRUQ92729 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PTPRUQ92729 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
PTPRUQ92729 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PTPRUQ92729 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PTPRUQ92729 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC36.38■■■■□ 3.41
PTPRUQ92729 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
PTPRUQ92729 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
PTPRUQ92729 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms