Protein–RNA interactions for Protein: Q92570

NR4A3, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 3, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A3Q92570 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
NR4A3Q92570 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
NR4A3Q92570 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR4A3Q92570 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR4A3Q92570 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
NR4A3Q92570 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR4A3Q92570 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR4A3Q92570 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR4A3Q92570 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR4A3Q92570 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR4A3Q92570 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
NR4A3Q92570 COL13A1-213ENST00000520267 2276 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
NR4A3Q92570 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NR4A3Q92570 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
NR4A3Q92570 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR4A3Q92570 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR4A3Q92570 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR4A3Q92570 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR4A3Q92570 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR4A3Q92570 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
NR4A3Q92570 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR4A3Q92570 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR4A3Q92570 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR4A3Q92570 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR4A3Q92570 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR4A3Q92570 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR4A3Q92570 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
NR4A3Q92570 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
NR4A3Q92570 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR4A3Q92570 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR4A3Q92570 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR4A3Q92570 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR4A3Q92570 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR4A3Q92570 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
NR4A3Q92570 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NR4A3Q92570 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NR4A3Q92570 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NR4A3Q92570 ACTR3B-201ENST00000256001 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NR4A3Q92570 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NR4A3Q92570 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR4A3Q92570 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR4A3Q92570 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR4A3Q92570 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NR4A3Q92570 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR4A3Q92570 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR4A3Q92570 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR4A3Q92570 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR4A3Q92570 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NR4A3Q92570 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR4A3Q92570 NOG-201ENST00000332822 1892 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NR4A3Q92570 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR4A3Q92570 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NR4A3Q92570 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR4A3Q92570 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR4A3Q92570 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR4A3Q92570 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NR4A3Q92570 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR4A3Q92570 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR4A3Q92570 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR4A3Q92570 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR4A3Q92570 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NR4A3Q92570 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NR4A3Q92570 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR4A3Q92570 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR4A3Q92570 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NR4A3Q92570 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR4A3Q92570 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR4A3Q92570 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
NR4A3Q92570 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR4A3Q92570 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NR4A3Q92570 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
NR4A3Q92570 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NR4A3Q92570 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NR4A3Q92570 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NR4A3Q92570 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NR4A3Q92570 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NR4A3Q92570 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NR4A3Q92570 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NR4A3Q92570 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NR4A3Q92570 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NR4A3Q92570 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NR4A3Q92570 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
NR4A3Q92570 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR4A3Q92570 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR4A3Q92570 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR4A3Q92570 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR4A3Q92570 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR4A3Q92570 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NR4A3Q92570 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NR4A3Q92570 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms