Protein–RNA interactions for Protein: Q8WVN8

UBE2Q2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 Q2, humanhuman

Predictions only

Length 375 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2Q2Q8WVN8 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBE2Q2Q8WVN8 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBE2Q2Q8WVN8 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
UBE2Q2Q8WVN8 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBE2Q2Q8WVN8 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBE2Q2Q8WVN8 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBE2Q2Q8WVN8 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBE2Q2Q8WVN8 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBE2Q2Q8WVN8 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
UBE2Q2Q8WVN8 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBE2Q2Q8WVN8 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
UBE2Q2Q8WVN8 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
UBE2Q2Q8WVN8 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBE2Q2Q8WVN8 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBE2Q2Q8WVN8 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBE2Q2Q8WVN8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBE2Q2Q8WVN8 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBE2Q2Q8WVN8 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBE2Q2Q8WVN8 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBE2Q2Q8WVN8 AC079834.2-201ENST00000609776 1949 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
UBE2Q2Q8WVN8 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBE2Q2Q8WVN8 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
UBE2Q2Q8WVN8 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE2Q2Q8WVN8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE2Q2Q8WVN8 PHOX2B-201ENST00000226382 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE2Q2Q8WVN8 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE2Q2Q8WVN8 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE2Q2Q8WVN8 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
UBE2Q2Q8WVN8 SLAIN1-206ENST00000418532 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBE2Q2Q8WVN8 TMC7-205ENST00000569532 2738 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
UBE2Q2Q8WVN8 HNRNPAB-206ENST00000506339 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBE2Q2Q8WVN8 ATAD3A-202ENST00000378755 2612 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBE2Q2Q8WVN8 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
UBE2Q2Q8WVN8 RARA-201ENST00000254066 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
UBE2Q2Q8WVN8 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE2Q2Q8WVN8 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE2Q2Q8WVN8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE2Q2Q8WVN8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE2Q2Q8WVN8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE2Q2Q8WVN8 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
UBE2Q2Q8WVN8 DES-201ENST00000373960 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBE2Q2Q8WVN8 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
UBE2Q2Q8WVN8 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
UBE2Q2Q8WVN8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBE2Q2Q8WVN8 BARHL1-201ENST00000263610 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBE2Q2Q8WVN8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
UBE2Q2Q8WVN8 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBE2Q2Q8WVN8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBE2Q2Q8WVN8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
UBE2Q2Q8WVN8 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBE2Q2Q8WVN8 ABHD12-201ENST00000339157 2117 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBE2Q2Q8WVN8 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
UBE2Q2Q8WVN8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBE2Q2Q8WVN8 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBE2Q2Q8WVN8 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
UBE2Q2Q8WVN8 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
UBE2Q2Q8WVN8 ARX-201ENST00000379044 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE2Q2Q8WVN8 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE2Q2Q8WVN8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE2Q2Q8WVN8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
UBE2Q2Q8WVN8 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
UBE2Q2Q8WVN8 KLC2-207ENST00000421552 2721 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBE2Q2Q8WVN8 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBE2Q2Q8WVN8 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
UBE2Q2Q8WVN8 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
UBE2Q2Q8WVN8 ACTR3B-202ENST00000377776 1566 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBE2Q2Q8WVN8 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBE2Q2Q8WVN8 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBE2Q2Q8WVN8 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
UBE2Q2Q8WVN8 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBE2Q2Q8WVN8 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBE2Q2Q8WVN8 TRIM3-214ENST00000536344 2704 ntTSL 2 BASIC28.24■■■□□ 2.11
UBE2Q2Q8WVN8 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBE2Q2Q8WVN8 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBE2Q2Q8WVN8 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
UBE2Q2Q8WVN8 CGREF1-202ENST00000312734 1610 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBE2Q2Q8WVN8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBE2Q2Q8WVN8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBE2Q2Q8WVN8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBE2Q2Q8WVN8 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
UBE2Q2Q8WVN8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
UBE2Q2Q8WVN8 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
UBE2Q2Q8WVN8 TPRN-202ENST00000409012 2718 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBE2Q2Q8WVN8 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBE2Q2Q8WVN8 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
UBE2Q2Q8WVN8 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBE2Q2Q8WVN8 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
UBE2Q2Q8WVN8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBE2Q2Q8WVN8 TSPAN11-203ENST00000545802 1649 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBE2Q2Q8WVN8 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
UBE2Q2Q8WVN8 TRIM3-201ENST00000345851 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE2Q2Q8WVN8 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE2Q2Q8WVN8 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE2Q2Q8WVN8 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
UBE2Q2Q8WVN8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBE2Q2Q8WVN8 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBE2Q2Q8WVN8 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBE2Q2Q8WVN8 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
UBE2Q2Q8WVN8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
UBE2Q2Q8WVN8 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.7 ms