Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUR7

C15orf40, UPF0235 protein C15orf40, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C15orf40Q8WUR7 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C15orf40Q8WUR7 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
C15orf40Q8WUR7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C15orf40Q8WUR7 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C15orf40Q8WUR7 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
C15orf40Q8WUR7 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C15orf40Q8WUR7 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22■■□□□ 1.11
C15orf40Q8WUR7 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C15orf40Q8WUR7 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
C15orf40Q8WUR7 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
C15orf40Q8WUR7 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C15orf40Q8WUR7 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C15orf40Q8WUR7 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C15orf40Q8WUR7 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C15orf40Q8WUR7 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C15orf40Q8WUR7 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
C15orf40Q8WUR7 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
C15orf40Q8WUR7 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C15orf40Q8WUR7 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C15orf40Q8WUR7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C15orf40Q8WUR7 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
C15orf40Q8WUR7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
C15orf40Q8WUR7 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
C15orf40Q8WUR7 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C15orf40Q8WUR7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
C15orf40Q8WUR7 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
C15orf40Q8WUR7 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C15orf40Q8WUR7 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C15orf40Q8WUR7 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C15orf40Q8WUR7 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C15orf40Q8WUR7 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
C15orf40Q8WUR7 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C15orf40Q8WUR7 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
C15orf40Q8WUR7 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C15orf40Q8WUR7 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
C15orf40Q8WUR7 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C15orf40Q8WUR7 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
C15orf40Q8WUR7 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C15orf40Q8WUR7 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C15orf40Q8WUR7 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
C15orf40Q8WUR7 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
C15orf40Q8WUR7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C15orf40Q8WUR7 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
C15orf40Q8WUR7 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C15orf40Q8WUR7 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C15orf40Q8WUR7 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
C15orf40Q8WUR7 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C15orf40Q8WUR7 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C15orf40Q8WUR7 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C15orf40Q8WUR7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
C15orf40Q8WUR7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C15orf40Q8WUR7 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C15orf40Q8WUR7 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
C15orf40Q8WUR7 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
C15orf40Q8WUR7 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
C15orf40Q8WUR7 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C15orf40Q8WUR7 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C15orf40Q8WUR7 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C15orf40Q8WUR7 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
C15orf40Q8WUR7 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C15orf40Q8WUR7 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
C15orf40Q8WUR7 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C15orf40Q8WUR7 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C15orf40Q8WUR7 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
C15orf40Q8WUR7 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C15orf40Q8WUR7 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
C15orf40Q8WUR7 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
C15orf40Q8WUR7 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C15orf40Q8WUR7 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C15orf40Q8WUR7 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C15orf40Q8WUR7 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
C15orf40Q8WUR7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C15orf40Q8WUR7 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
C15orf40Q8WUR7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
C15orf40Q8WUR7 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C15orf40Q8WUR7 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
C15orf40Q8WUR7 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
C15orf40Q8WUR7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
C15orf40Q8WUR7 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C15orf40Q8WUR7 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C15orf40Q8WUR7 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
C15orf40Q8WUR7 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C15orf40Q8WUR7 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C15orf40Q8WUR7 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C15orf40Q8WUR7 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C15orf40Q8WUR7 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C15orf40Q8WUR7 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
C15orf40Q8WUR7 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
C15orf40Q8WUR7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
C15orf40Q8WUR7 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
C15orf40Q8WUR7 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C15orf40Q8WUR7 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
C15orf40Q8WUR7 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
C15orf40Q8WUR7 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C15orf40Q8WUR7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
C15orf40Q8WUR7 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C15orf40Q8WUR7 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
C15orf40Q8WUR7 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C15orf40Q8WUR7 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
C15orf40Q8WUR7 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
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