Protein–RNA interactions for Protein: Q8TB24

RIN3, Ras and Rab interactor 3, humanhuman

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RIN3Q8TB24 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.83■■□□□ 1.89
RIN3Q8TB24 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.88
RIN3Q8TB24 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC26.82■■□□□ 1.88
RIN3Q8TB24 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
RIN3Q8TB24 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIN3Q8TB24 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIN3Q8TB24 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIN3Q8TB24 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIN3Q8TB24 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIN3Q8TB24 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIN3Q8TB24 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIN3Q8TB24 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIN3Q8TB24 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
RIN3Q8TB24 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIN3Q8TB24 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIN3Q8TB24 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.79■■□□□ 1.88
RIN3Q8TB24 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
RIN3Q8TB24 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIN3Q8TB24 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIN3Q8TB24 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIN3Q8TB24 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIN3Q8TB24 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIN3Q8TB24 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
RIN3Q8TB24 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIN3Q8TB24 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIN3Q8TB24 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.76■■□□□ 1.87
RIN3Q8TB24 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIN3Q8TB24 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIN3Q8TB24 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
RIN3Q8TB24 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIN3Q8TB24 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
RIN3Q8TB24 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIN3Q8TB24 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIN3Q8TB24 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
RIN3Q8TB24 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIN3Q8TB24 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC26.72■■□□□ 1.87
RIN3Q8TB24 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIN3Q8TB24 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIN3Q8TB24 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIN3Q8TB24 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIN3Q8TB24 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIN3Q8TB24 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIN3Q8TB24 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
RIN3Q8TB24 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
RIN3Q8TB24 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIN3Q8TB24 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIN3Q8TB24 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIN3Q8TB24 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIN3Q8TB24 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC26.69■■□□□ 1.86
RIN3Q8TB24 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
RIN3Q8TB24 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIN3Q8TB24 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIN3Q8TB24 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
RIN3Q8TB24 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIN3Q8TB24 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIN3Q8TB24 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIN3Q8TB24 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
RIN3Q8TB24 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
RIN3Q8TB24 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIN3Q8TB24 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
RIN3Q8TB24 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
RIN3Q8TB24 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIN3Q8TB24 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIN3Q8TB24 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIN3Q8TB24 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIN3Q8TB24 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
RIN3Q8TB24 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIN3Q8TB24 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIN3Q8TB24 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
RIN3Q8TB24 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC26.61■■□□□ 1.85
RIN3Q8TB24 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIN3Q8TB24 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RIN3Q8TB24 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIN3Q8TB24 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIN3Q8TB24 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIN3Q8TB24 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIN3Q8TB24 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
RIN3Q8TB24 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC26.6■■□□□ 1.85
RIN3Q8TB24 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
RIN3Q8TB24 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIN3Q8TB24 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIN3Q8TB24 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIN3Q8TB24 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
RIN3Q8TB24 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
RIN3Q8TB24 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIN3Q8TB24 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIN3Q8TB24 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIN3Q8TB24 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIN3Q8TB24 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
RIN3Q8TB24 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIN3Q8TB24 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIN3Q8TB24 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
RIN3Q8TB24 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIN3Q8TB24 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
RIN3Q8TB24 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIN3Q8TB24 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
RIN3Q8TB24 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIN3Q8TB24 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIN3Q8TB24 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
RIN3Q8TB24 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.1 ms