Protein–RNA interactions for Protein: Q8NI29

FBXO27, F-box only protein 27, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FBXO27Q8NI29 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
FBXO27Q8NI29 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FBXO27Q8NI29 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO27Q8NI29 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FBXO27Q8NI29 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
FBXO27Q8NI29 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO27Q8NI29 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO27Q8NI29 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO27Q8NI29 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO27Q8NI29 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO27Q8NI29 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FBXO27Q8NI29 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO27Q8NI29 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO27Q8NI29 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO27Q8NI29 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FBXO27Q8NI29 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO27Q8NI29 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO27Q8NI29 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FBXO27Q8NI29 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO27Q8NI29 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO27Q8NI29 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FBXO27Q8NI29 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FBXO27Q8NI29 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FBXO27Q8NI29 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
FBXO27Q8NI29 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO27Q8NI29 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO27Q8NI29 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO27Q8NI29 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO27Q8NI29 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO27Q8NI29 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
FBXO27Q8NI29 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO27Q8NI29 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.79■■□□□ 1.56
FBXO27Q8NI29 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO27Q8NI29 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO27Q8NI29 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO27Q8NI29 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO27Q8NI29 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
FBXO27Q8NI29 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO27Q8NI29 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO27Q8NI29 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
FBXO27Q8NI29 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO27Q8NI29 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FBXO27Q8NI29 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO27Q8NI29 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO27Q8NI29 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO27Q8NI29 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FBXO27Q8NI29 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO27Q8NI29 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO27Q8NI29 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FBXO27Q8NI29 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO27Q8NI29 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO27Q8NI29 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO27Q8NI29 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO27Q8NI29 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO27Q8NI29 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO27Q8NI29 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FBXO27Q8NI29 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO27Q8NI29 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO27Q8NI29 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO27Q8NI29 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FBXO27Q8NI29 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FBXO27Q8NI29 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO27Q8NI29 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO27Q8NI29 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FBXO27Q8NI29 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FBXO27Q8NI29 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO27Q8NI29 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO27Q8NI29 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO27Q8NI29 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FBXO27Q8NI29 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO27Q8NI29 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO27Q8NI29 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO27Q8NI29 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO27Q8NI29 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FBXO27Q8NI29 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO27Q8NI29 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO27Q8NI29 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO27Q8NI29 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO27Q8NI29 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO27Q8NI29 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO27Q8NI29 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO27Q8NI29 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
FBXO27Q8NI29 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
FBXO27Q8NI29 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FBXO27Q8NI29 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.9 ms