Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHS4

CLHC1, Clathrin heavy chain linker domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 586 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLHC1Q8NHS4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLHC1Q8NHS4 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLHC1Q8NHS4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLHC1Q8NHS4 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
CLHC1Q8NHS4 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
CLHC1Q8NHS4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
CLHC1Q8NHS4 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLHC1Q8NHS4 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
CLHC1Q8NHS4 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
CLHC1Q8NHS4 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
CLHC1Q8NHS4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLHC1Q8NHS4 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLHC1Q8NHS4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLHC1Q8NHS4 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLHC1Q8NHS4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLHC1Q8NHS4 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLHC1Q8NHS4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
CLHC1Q8NHS4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLHC1Q8NHS4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLHC1Q8NHS4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
CLHC1Q8NHS4 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLHC1Q8NHS4 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLHC1Q8NHS4 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
CLHC1Q8NHS4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLHC1Q8NHS4 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLHC1Q8NHS4 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLHC1Q8NHS4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
CLHC1Q8NHS4 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLHC1Q8NHS4 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLHC1Q8NHS4 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
CLHC1Q8NHS4 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
CLHC1Q8NHS4 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLHC1Q8NHS4 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
CLHC1Q8NHS4 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLHC1Q8NHS4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
CLHC1Q8NHS4 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
CLHC1Q8NHS4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLHC1Q8NHS4 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
CLHC1Q8NHS4 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLHC1Q8NHS4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLHC1Q8NHS4 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLHC1Q8NHS4 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLHC1Q8NHS4 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLHC1Q8NHS4 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
CLHC1Q8NHS4 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLHC1Q8NHS4 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLHC1Q8NHS4 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLHC1Q8NHS4 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
CLHC1Q8NHS4 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLHC1Q8NHS4 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLHC1Q8NHS4 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLHC1Q8NHS4 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLHC1Q8NHS4 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLHC1Q8NHS4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
CLHC1Q8NHS4 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
CLHC1Q8NHS4 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLHC1Q8NHS4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
CLHC1Q8NHS4 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
CLHC1Q8NHS4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLHC1Q8NHS4 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLHC1Q8NHS4 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLHC1Q8NHS4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLHC1Q8NHS4 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLHC1Q8NHS4 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLHC1Q8NHS4 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLHC1Q8NHS4 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLHC1Q8NHS4 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
CLHC1Q8NHS4 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLHC1Q8NHS4 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLHC1Q8NHS4 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
CLHC1Q8NHS4 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.9 ms