Protein–RNA interactions for Protein: Q8NHH9

ATL2, Atlastin-2, humanhuman

Predictions only

Length 583 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL2Q8NHH9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 MXI1-201ENST00000239007 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.65■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ATL2Q8NHH9 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATL2Q8NHH9 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
ATL2Q8NHH9 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATL2Q8NHH9 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATL2Q8NHH9 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATL2Q8NHH9 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATL2Q8NHH9 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC26.63■■□□□ 1.85
ATL2Q8NHH9 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATL2Q8NHH9 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATL2Q8NHH9 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATL2Q8NHH9 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ATL2Q8NHH9 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATL2Q8NHH9 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATL2Q8NHH9 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATL2Q8NHH9 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ATL2Q8NHH9 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATL2Q8NHH9 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATL2Q8NHH9 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ATL2Q8NHH9 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATL2Q8NHH9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ATL2Q8NHH9 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATL2Q8NHH9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ATL2Q8NHH9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATL2Q8NHH9 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATL2Q8NHH9 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
ATL2Q8NHH9 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATL2Q8NHH9 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ATL2Q8NHH9 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATL2Q8NHH9 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATL2Q8NHH9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ATL2Q8NHH9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ATL2Q8NHH9 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATL2Q8NHH9 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATL2Q8NHH9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATL2Q8NHH9 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ATL2Q8NHH9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATL2Q8NHH9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATL2Q8NHH9 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ATL2Q8NHH9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATL2Q8NHH9 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATL2Q8NHH9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATL2Q8NHH9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATL2Q8NHH9 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATL2Q8NHH9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATL2Q8NHH9 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATL2Q8NHH9 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATL2Q8NHH9 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATL2Q8NHH9 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ATL2Q8NHH9 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATL2Q8NHH9 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ATL2Q8NHH9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.84
ATL2Q8NHH9 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATL2Q8NHH9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATL2Q8NHH9 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATL2Q8NHH9 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATL2Q8NHH9 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ATL2Q8NHH9 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATL2Q8NHH9 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATL2Q8NHH9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
ATL2Q8NHH9 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATL2Q8NHH9 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATL2Q8NHH9 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATL2Q8NHH9 ZNF276-202ENST00000443381 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATL2Q8NHH9 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
ATL2Q8NHH9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATL2Q8NHH9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATL2Q8NHH9 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATL2Q8NHH9 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
ATL2Q8NHH9 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATL2Q8NHH9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC26.47■■□□□ 1.83
ATL2Q8NHH9 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATL2Q8NHH9 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATL2Q8NHH9 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATL2Q8NHH9 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
ATL2Q8NHH9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATL2Q8NHH9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
ATL2Q8NHH9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATL2Q8NHH9 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATL2Q8NHH9 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
ATL2Q8NHH9 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATL2Q8NHH9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
ATL2Q8NHH9 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
ATL2Q8NHH9 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
ATL2Q8NHH9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
ATL2Q8NHH9 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
ATL2Q8NHH9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
ATL2Q8NHH9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms