Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFH3

NUP43, Nucleoporin Nup43, humanhuman

Predictions only

Length 380 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP43Q8NFH3 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP43Q8NFH3 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP43Q8NFH3 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP43Q8NFH3 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
NUP43Q8NFH3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP43Q8NFH3 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP43Q8NFH3 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
NUP43Q8NFH3 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP43Q8NFH3 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP43Q8NFH3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP43Q8NFH3 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP43Q8NFH3 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
NUP43Q8NFH3 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP43Q8NFH3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP43Q8NFH3 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP43Q8NFH3 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP43Q8NFH3 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
NUP43Q8NFH3 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP43Q8NFH3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
NUP43Q8NFH3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP43Q8NFH3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP43Q8NFH3 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
NUP43Q8NFH3 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NUP43Q8NFH3 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
NUP43Q8NFH3 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
NUP43Q8NFH3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP43Q8NFH3 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
NUP43Q8NFH3 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP43Q8NFH3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP43Q8NFH3 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP43Q8NFH3 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP43Q8NFH3 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
NUP43Q8NFH3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP43Q8NFH3 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP43Q8NFH3 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC23.86■■□□□ 1.41
NUP43Q8NFH3 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP43Q8NFH3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP43Q8NFH3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP43Q8NFH3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP43Q8NFH3 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
NUP43Q8NFH3 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP43Q8NFH3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP43Q8NFH3 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP43Q8NFH3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP43Q8NFH3 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP43Q8NFH3 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP43Q8NFH3 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
NUP43Q8NFH3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC23.83■■□□□ 1.41
NUP43Q8NFH3 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUP43Q8NFH3 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC23.83■■□□□ 1.4
NUP43Q8NFH3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP43Q8NFH3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP43Q8NFH3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
NUP43Q8NFH3 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP43Q8NFH3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP43Q8NFH3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP43Q8NFH3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
NUP43Q8NFH3 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP43Q8NFH3 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP43Q8NFH3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP43Q8NFH3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP43Q8NFH3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP43Q8NFH3 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP43Q8NFH3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
NUP43Q8NFH3 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
NUP43Q8NFH3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.4 ms