Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEK5

ZNF548, Zinc finger protein 548, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 533 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF548Q8NEK5 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF548Q8NEK5 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
ZNF548Q8NEK5 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF548Q8NEK5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF548Q8NEK5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF548Q8NEK5 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
ZNF548Q8NEK5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF548Q8NEK5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF548Q8NEK5 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
ZNF548Q8NEK5 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF548Q8NEK5 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
ZNF548Q8NEK5 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF548Q8NEK5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
ZNF548Q8NEK5 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF548Q8NEK5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
ZNF548Q8NEK5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF548Q8NEK5 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.5■■□□□ 1.67
ZNF548Q8NEK5 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF548Q8NEK5 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF548Q8NEK5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF548Q8NEK5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF548Q8NEK5 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF548Q8NEK5 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
ZNF548Q8NEK5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF548Q8NEK5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF548Q8NEK5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF548Q8NEK5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
ZNF548Q8NEK5 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF548Q8NEK5 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF548Q8NEK5 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
ZNF548Q8NEK5 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
ZNF548Q8NEK5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
ZNF548Q8NEK5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC25.43■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
ZNF548Q8NEK5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF548Q8NEK5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF548Q8NEK5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF548Q8NEK5 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF548Q8NEK5 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
ZNF548Q8NEK5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF548Q8NEK5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF548Q8NEK5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF548Q8NEK5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF548Q8NEK5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
ZNF548Q8NEK5 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF548Q8NEK5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF548Q8NEK5 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
ZNF548Q8NEK5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
ZNF548Q8NEK5 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF548Q8NEK5 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
ZNF548Q8NEK5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF548Q8NEK5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF548Q8NEK5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
ZNF548Q8NEK5 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
ZNF548Q8NEK5 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF548Q8NEK5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF548Q8NEK5 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF548Q8NEK5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF548Q8NEK5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.32■■□□□ 1.64
ZNF548Q8NEK5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF548Q8NEK5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF548Q8NEK5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
ZNF548Q8NEK5 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF548Q8NEK5 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF548Q8NEK5 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF548Q8NEK5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF548Q8NEK5 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ZNF548Q8NEK5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF548Q8NEK5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ZNF548Q8NEK5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF548Q8NEK5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF548Q8NEK5 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ZNF548Q8NEK5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
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