Protein–RNA interactions for Protein: Q8ND30

PPFIBP2, Liprin-beta-2, humanhuman

Predictions only

Length 876 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPFIBP2Q8ND30 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
PPFIBP2Q8ND30 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIBP2Q8ND30 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIBP2Q8ND30 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIBP2Q8ND30 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
PPFIBP2Q8ND30 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIBP2Q8ND30 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
PPFIBP2Q8ND30 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
PPFIBP2Q8ND30 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIBP2Q8ND30 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIBP2Q8ND30 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
PPFIBP2Q8ND30 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIBP2Q8ND30 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIBP2Q8ND30 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
PPFIBP2Q8ND30 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIBP2Q8ND30 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIBP2Q8ND30 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIBP2Q8ND30 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
PPFIBP2Q8ND30 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
PPFIBP2Q8ND30 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIBP2Q8ND30 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIBP2Q8ND30 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIBP2Q8ND30 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIBP2Q8ND30 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
PPFIBP2Q8ND30 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIBP2Q8ND30 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIBP2Q8ND30 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIBP2Q8ND30 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIBP2Q8ND30 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
PPFIBP2Q8ND30 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIBP2Q8ND30 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
PPFIBP2Q8ND30 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIBP2Q8ND30 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIBP2Q8ND30 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIBP2Q8ND30 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
PPFIBP2Q8ND30 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIBP2Q8ND30 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIBP2Q8ND30 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIBP2Q8ND30 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
PPFIBP2Q8ND30 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIBP2Q8ND30 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.4■■□□□ 1.66
PPFIBP2Q8ND30 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIBP2Q8ND30 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIBP2Q8ND30 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
PPFIBP2Q8ND30 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
PPFIBP2Q8ND30 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIBP2Q8ND30 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIBP2Q8ND30 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
PPFIBP2Q8ND30 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIBP2Q8ND30 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIBP2Q8ND30 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIBP2Q8ND30 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIBP2Q8ND30 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PPFIBP2Q8ND30 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIBP2Q8ND30 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIBP2Q8ND30 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIBP2Q8ND30 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PPFIBP2Q8ND30 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIBP2Q8ND30 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIBP2Q8ND30 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIBP2Q8ND30 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PPFIBP2Q8ND30 DSG2-201ENST00000261590 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIBP2Q8ND30 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIBP2Q8ND30 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIBP2Q8ND30 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIBP2Q8ND30 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIBP2Q8ND30 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIBP2Q8ND30 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIBP2Q8ND30 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PPFIBP2Q8ND30 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIBP2Q8ND30 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIBP2Q8ND30 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PPFIBP2Q8ND30 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PPFIBP2Q8ND30 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIBP2Q8ND30 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIBP2Q8ND30 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIBP2Q8ND30 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIBP2Q8ND30 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIBP2Q8ND30 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PPFIBP2Q8ND30 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIBP2Q8ND30 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIBP2Q8ND30 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIBP2Q8ND30 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PPFIBP2Q8ND30 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIBP2Q8ND30 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIBP2Q8ND30 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIBP2Q8ND30 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PPFIBP2Q8ND30 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIBP2Q8ND30 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIBP2Q8ND30 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PPFIBP2Q8ND30 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIBP2Q8ND30 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIBP2Q8ND30 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PPFIBP2Q8ND30 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIBP2Q8ND30 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIBP2Q8ND30 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PPFIBP2Q8ND30 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIBP2Q8ND30 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PPFIBP2Q8ND30 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PPFIBP2Q8ND30 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms