Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBU5

ATAD1, ATPase family AAA domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD1Q8NBU5 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ATAD1Q8NBU5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATAD1Q8NBU5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATAD1Q8NBU5 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
ATAD1Q8NBU5 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATAD1Q8NBU5 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATAD1Q8NBU5 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
ATAD1Q8NBU5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ATAD1Q8NBU5 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATAD1Q8NBU5 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATAD1Q8NBU5 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ATAD1Q8NBU5 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ATAD1Q8NBU5 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATAD1Q8NBU5 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATAD1Q8NBU5 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ATAD1Q8NBU5 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ATAD1Q8NBU5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ATAD1Q8NBU5 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ATAD1Q8NBU5 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATAD1Q8NBU5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ATAD1Q8NBU5 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATAD1Q8NBU5 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ATAD1Q8NBU5 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATAD1Q8NBU5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATAD1Q8NBU5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATAD1Q8NBU5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ATAD1Q8NBU5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATAD1Q8NBU5 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ATAD1Q8NBU5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATAD1Q8NBU5 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATAD1Q8NBU5 ARMC10-211ENST00000541300 2266 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATAD1Q8NBU5 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATAD1Q8NBU5 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ATAD1Q8NBU5 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATAD1Q8NBU5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATAD1Q8NBU5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ATAD1Q8NBU5 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATAD1Q8NBU5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATAD1Q8NBU5 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATAD1Q8NBU5 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATAD1Q8NBU5 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ATAD1Q8NBU5 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATAD1Q8NBU5 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATAD1Q8NBU5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATAD1Q8NBU5 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATAD1Q8NBU5 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ATAD1Q8NBU5 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATAD1Q8NBU5 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATAD1Q8NBU5 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATAD1Q8NBU5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ATAD1Q8NBU5 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATAD1Q8NBU5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATAD1Q8NBU5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATAD1Q8NBU5 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ATAD1Q8NBU5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATAD1Q8NBU5 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATAD1Q8NBU5 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATAD1Q8NBU5 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC27.03■■□□□ 1.92
ATAD1Q8NBU5 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATAD1Q8NBU5 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATAD1Q8NBU5 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ATAD1Q8NBU5 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATAD1Q8NBU5 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATAD1Q8NBU5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATAD1Q8NBU5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ATAD1Q8NBU5 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
ATAD1Q8NBU5 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 102.3 ms