Protein–RNA interactions for Protein: Q8NBD8

TMEM229B, Transmembrane protein 229B, humanhuman

Predictions only

Length 167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM229BQ8NBD8 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM229BQ8NBD8 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
TMEM229BQ8NBD8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM229BQ8NBD8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM229BQ8NBD8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM229BQ8NBD8 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM229BQ8NBD8 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
TMEM229BQ8NBD8 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM229BQ8NBD8 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM229BQ8NBD8 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM229BQ8NBD8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM229BQ8NBD8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM229BQ8NBD8 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
TMEM229BQ8NBD8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM229BQ8NBD8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM229BQ8NBD8 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM229BQ8NBD8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
TMEM229BQ8NBD8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM229BQ8NBD8 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM229BQ8NBD8 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM229BQ8NBD8 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM229BQ8NBD8 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM229BQ8NBD8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
TMEM229BQ8NBD8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM229BQ8NBD8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
TMEM229BQ8NBD8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM229BQ8NBD8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
TMEM229BQ8NBD8 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM229BQ8NBD8 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM229BQ8NBD8 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM229BQ8NBD8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
TMEM229BQ8NBD8 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM229BQ8NBD8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM229BQ8NBD8 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
TMEM229BQ8NBD8 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM229BQ8NBD8 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM229BQ8NBD8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
TMEM229BQ8NBD8 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM229BQ8NBD8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM229BQ8NBD8 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM229BQ8NBD8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
TMEM229BQ8NBD8 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM229BQ8NBD8 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM229BQ8NBD8 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM229BQ8NBD8 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM229BQ8NBD8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM229BQ8NBD8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
TMEM229BQ8NBD8 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM229BQ8NBD8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM229BQ8NBD8 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
TMEM229BQ8NBD8 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
TMEM229BQ8NBD8 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM229BQ8NBD8 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
TMEM229BQ8NBD8 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM229BQ8NBD8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM229BQ8NBD8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM229BQ8NBD8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
TMEM229BQ8NBD8 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM229BQ8NBD8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM229BQ8NBD8 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM229BQ8NBD8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM229BQ8NBD8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
TMEM229BQ8NBD8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM229BQ8NBD8 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM229BQ8NBD8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM229BQ8NBD8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM229BQ8NBD8 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM229BQ8NBD8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
TMEM229BQ8NBD8 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM229BQ8NBD8 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM229BQ8NBD8 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
TMEM229BQ8NBD8 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM229BQ8NBD8 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM229BQ8NBD8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM229BQ8NBD8 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM229BQ8NBD8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
TMEM229BQ8NBD8 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM229BQ8NBD8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM229BQ8NBD8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
TMEM229BQ8NBD8 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM229BQ8NBD8 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM229BQ8NBD8 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM229BQ8NBD8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
TMEM229BQ8NBD8 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
TMEM229BQ8NBD8 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM229BQ8NBD8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM229BQ8NBD8 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM229BQ8NBD8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM229BQ8NBD8 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM229BQ8NBD8 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
TMEM229BQ8NBD8 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM229BQ8NBD8 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM229BQ8NBD8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM229BQ8NBD8 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM229BQ8NBD8 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
TMEM229BQ8NBD8 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM229BQ8NBD8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM229BQ8NBD8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM229BQ8NBD8 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
TMEM229BQ8NBD8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.7 ms