Protein–RNA interactions for Protein: Q8N6G5

CSGALNACT2, Chondroitin sulfate N-acetylgalactosaminyltransferase 2, humanhuman

Predictions only

Length 542 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSGALNACT2Q8N6G5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
CSGALNACT2Q8N6G5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSGALNACT2Q8N6G5 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSGALNACT2Q8N6G5 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
CSGALNACT2Q8N6G5 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
CSGALNACT2Q8N6G5 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSGALNACT2Q8N6G5 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
CSGALNACT2Q8N6G5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSGALNACT2Q8N6G5 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSGALNACT2Q8N6G5 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
CSGALNACT2Q8N6G5 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC28.39■■■□□ 2.14
CSGALNACT2Q8N6G5 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSGALNACT2Q8N6G5 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC28.38■■■□□ 2.13
CSGALNACT2Q8N6G5 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSGALNACT2Q8N6G5 TCFL5-202ENST00000335351 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSGALNACT2Q8N6G5 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSGALNACT2Q8N6G5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSGALNACT2Q8N6G5 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSGALNACT2Q8N6G5 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
CSGALNACT2Q8N6G5 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC28.35■■■□□ 2.13
CSGALNACT2Q8N6G5 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSGALNACT2Q8N6G5 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSGALNACT2Q8N6G5 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
CSGALNACT2Q8N6G5 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSGALNACT2Q8N6G5 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSGALNACT2Q8N6G5 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSGALNACT2Q8N6G5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
CSGALNACT2Q8N6G5 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSGALNACT2Q8N6G5 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSGALNACT2Q8N6G5 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
CSGALNACT2Q8N6G5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSGALNACT2Q8N6G5 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSGALNACT2Q8N6G5 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSGALNACT2Q8N6G5 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
CSGALNACT2Q8N6G5 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSGALNACT2Q8N6G5 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
CSGALNACT2Q8N6G5 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSGALNACT2Q8N6G5 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSGALNACT2Q8N6G5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSGALNACT2Q8N6G5 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSGALNACT2Q8N6G5 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSGALNACT2Q8N6G5 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
CSGALNACT2Q8N6G5 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSGALNACT2Q8N6G5 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
CSGALNACT2Q8N6G5 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CSGALNACT2Q8N6G5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
CSGALNACT2Q8N6G5 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CSGALNACT2Q8N6G5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CSGALNACT2Q8N6G5 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
CSGALNACT2Q8N6G5 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
CSGALNACT2Q8N6G5 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
CSGALNACT2Q8N6G5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
CSGALNACT2Q8N6G5 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.24■■■□□ 2.11
CSGALNACT2Q8N6G5 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSGALNACT2Q8N6G5 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
CSGALNACT2Q8N6G5 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC28.23■■■□□ 2.11
CSGALNACT2Q8N6G5 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CSGALNACT2Q8N6G5 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CSGALNACT2Q8N6G5 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CSGALNACT2Q8N6G5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF706-207ENST00000519882 959 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CSGALNACT2Q8N6G5 ZNF706-213ENST00000521272 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
CSGALNACT2Q8N6G5 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
CSGALNACT2Q8N6G5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
CSGALNACT2Q8N6G5 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CSGALNACT2Q8N6G5 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CSGALNACT2Q8N6G5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.21■■■□□ 2.11
CSGALNACT2Q8N6G5 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.11
CSGALNACT2Q8N6G5 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSGALNACT2Q8N6G5 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSGALNACT2Q8N6G5 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSGALNACT2Q8N6G5 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
CSGALNACT2Q8N6G5 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CSGALNACT2Q8N6G5 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CSGALNACT2Q8N6G5 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
CSGALNACT2Q8N6G5 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
CSGALNACT2Q8N6G5 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
CSGALNACT2Q8N6G5 ARHGEF7-206ENST00000375741 5525 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSGALNACT2Q8N6G5 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSGALNACT2Q8N6G5 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSGALNACT2Q8N6G5 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSGALNACT2Q8N6G5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC12A2-202ENST00000343225 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSGALNACT2Q8N6G5 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
CSGALNACT2Q8N6G5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
CSGALNACT2Q8N6G5 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSGALNACT2Q8N6G5 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
CSGALNACT2Q8N6G5 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
CSGALNACT2Q8N6G5 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
CSGALNACT2Q8N6G5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
CSGALNACT2Q8N6G5 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CSGALNACT2Q8N6G5 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CSGALNACT2Q8N6G5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
CSGALNACT2Q8N6G5 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
CSGALNACT2Q8N6G5 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms