Protein–RNA interactions for Protein: Q8N539

FIBCD1, Fibrinogen C domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FIBCD1Q8N539 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FIBCD1Q8N539 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
FIBCD1Q8N539 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FIBCD1Q8N539 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
FIBCD1Q8N539 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FIBCD1Q8N539 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FIBCD1Q8N539 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
FIBCD1Q8N539 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.87■■■□□ 2.05
FIBCD1Q8N539 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
FIBCD1Q8N539 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC27.86■■■□□ 2.05
FIBCD1Q8N539 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FIBCD1Q8N539 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
FIBCD1Q8N539 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC27.85■■■□□ 2.05
FIBCD1Q8N539 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
FIBCD1Q8N539 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FIBCD1Q8N539 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FIBCD1Q8N539 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
FIBCD1Q8N539 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.83■■■□□ 2.05
FIBCD1Q8N539 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.04
FIBCD1Q8N539 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FIBCD1Q8N539 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
FIBCD1Q8N539 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
FIBCD1Q8N539 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
FIBCD1Q8N539 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
FIBCD1Q8N539 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FIBCD1Q8N539 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
FIBCD1Q8N539 MAPK12-201ENST00000215659 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
FIBCD1Q8N539 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
FIBCD1Q8N539 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FIBCD1Q8N539 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
FIBCD1Q8N539 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
FIBCD1Q8N539 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
FIBCD1Q8N539 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FIBCD1Q8N539 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FIBCD1Q8N539 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
FIBCD1Q8N539 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
FIBCD1Q8N539 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FIBCD1Q8N539 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FIBCD1Q8N539 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FIBCD1Q8N539 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
FIBCD1Q8N539 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
FIBCD1Q8N539 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FIBCD1Q8N539 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
FIBCD1Q8N539 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
FIBCD1Q8N539 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FIBCD1Q8N539 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC27.73■■■□□ 2.03
FIBCD1Q8N539 CBX4-201ENST00000269397 2664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
FIBCD1Q8N539 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FIBCD1Q8N539 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FIBCD1Q8N539 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
FIBCD1Q8N539 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.72■■■□□ 2.03
FIBCD1Q8N539 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FIBCD1Q8N539 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.71■■■□□ 2.03
FIBCD1Q8N539 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
FIBCD1Q8N539 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.03
FIBCD1Q8N539 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
FIBCD1Q8N539 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FIBCD1Q8N539 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FIBCD1Q8N539 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FIBCD1Q8N539 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
FIBCD1Q8N539 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FIBCD1Q8N539 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.02
FIBCD1Q8N539 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.02
FIBCD1Q8N539 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC27.69■■■□□ 2.02
FIBCD1Q8N539 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FIBCD1Q8N539 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
FIBCD1Q8N539 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FIBCD1Q8N539 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.68■■■□□ 2.02
FIBCD1Q8N539 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.68■■■□□ 2.02
FIBCD1Q8N539 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC27.67■■■□□ 2.02
FIBCD1Q8N539 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.67■■■□□ 2.02
FIBCD1Q8N539 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
FIBCD1Q8N539 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.66■■■□□ 2.02
FIBCD1Q8N539 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC27.66■■■□□ 2.02
FIBCD1Q8N539 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.65■■■□□ 2.02
FIBCD1Q8N539 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.64■■■□□ 2.02
FIBCD1Q8N539 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FIBCD1Q8N539 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.63■■■□□ 2.01
FIBCD1Q8N539 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC27.63■■■□□ 2.01
FIBCD1Q8N539 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FIBCD1Q8N539 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
FIBCD1Q8N539 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FIBCD1Q8N539 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FIBCD1Q8N539 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.61■■■□□ 2.01
FIBCD1Q8N539 SLC15A4-201ENST00000266771 2779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
FIBCD1Q8N539 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FIBCD1Q8N539 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
FIBCD1Q8N539 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FIBCD1Q8N539 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FIBCD1Q8N539 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
FIBCD1Q8N539 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.6■■■□□ 2.01
FIBCD1Q8N539 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FIBCD1Q8N539 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FIBCD1Q8N539 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
FIBCD1Q8N539 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FIBCD1Q8N539 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FIBCD1Q8N539 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
FIBCD1Q8N539 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
FIBCD1Q8N539 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
FIBCD1Q8N539 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.9 ms