Protein–RNA interactions for Protein: Q8N4L8

CCDC24, Coiled-coil domain-containing protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC24Q8N4L8 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC24Q8N4L8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
CCDC24Q8N4L8 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
CCDC24Q8N4L8 LRRC61-202ENST00000359623 1877 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC24Q8N4L8 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
CCDC24Q8N4L8 WSB2-211ENST00000544233 2503 ntTSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC24Q8N4L8 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC24Q8N4L8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC32.49■■■□□ 2.79
CCDC24Q8N4L8 NPW-202ENST00000566435 991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC24Q8N4L8 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
CCDC24Q8N4L8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC24Q8N4L8 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC32.47■■■□□ 2.79
CCDC24Q8N4L8 TRIOBP-205ENST00000407319 2125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC24Q8N4L8 HMX1-201ENST00000400677 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.46■■■□□ 2.79
CCDC24Q8N4L8 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC24Q8N4L8 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC24Q8N4L8 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
CCDC24Q8N4L8 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.78
CCDC24Q8N4L8 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
CCDC24Q8N4L8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC24Q8N4L8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC24Q8N4L8 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.43■■■□□ 2.78
CCDC24Q8N4L8 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC24Q8N4L8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC24Q8N4L8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC24Q8N4L8 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC24Q8N4L8 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC32.42■■■□□ 2.78
CCDC24Q8N4L8 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC24Q8N4L8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC24Q8N4L8 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
CCDC24Q8N4L8 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC24Q8N4L8 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC24Q8N4L8 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
CCDC24Q8N4L8 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC24Q8N4L8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
CCDC24Q8N4L8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC24Q8N4L8 GRASP-201ENST00000293662 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.38■■■□□ 2.77
CCDC24Q8N4L8 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC24Q8N4L8 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC24Q8N4L8 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
CCDC24Q8N4L8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
CCDC24Q8N4L8 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC24Q8N4L8 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC32.35■■■□□ 2.77
CCDC24Q8N4L8 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC24Q8N4L8 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC24Q8N4L8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
CCDC24Q8N4L8 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC24Q8N4L8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC24Q8N4L8 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
CCDC24Q8N4L8 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC24Q8N4L8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
CCDC24Q8N4L8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC24Q8N4L8 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC24Q8N4L8 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC24Q8N4L8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC24Q8N4L8 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
CCDC24Q8N4L8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC24Q8N4L8 PXMP2-205ENST00000543589 632 ntTSL 3 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC24Q8N4L8 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC24Q8N4L8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.3■■■□□ 2.76
CCDC24Q8N4L8 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
CCDC24Q8N4L8 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC24Q8N4L8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC24Q8N4L8 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
CCDC24Q8N4L8 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC32.27■■■□□ 2.76
CCDC24Q8N4L8 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.26■■■□□ 2.75
CCDC24Q8N4L8 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC24Q8N4L8 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC24Q8N4L8 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC24Q8N4L8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC24Q8N4L8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC24Q8N4L8 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
CCDC24Q8N4L8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC24Q8N4L8 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC24Q8N4L8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
CCDC24Q8N4L8 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC24Q8N4L8 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC24Q8N4L8 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
CCDC24Q8N4L8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC24Q8N4L8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
CCDC24Q8N4L8 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC24Q8N4L8 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
CCDC24Q8N4L8 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC24Q8N4L8 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC24Q8N4L8 FGF13-AS1-202ENST00000446383 584 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC24Q8N4L8 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
CCDC24Q8N4L8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC24Q8N4L8 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC24Q8N4L8 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC24Q8N4L8 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC24Q8N4L8 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC24Q8N4L8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC32.18■■■□□ 2.74
CCDC24Q8N4L8 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC32.17■■■□□ 2.74
CCDC24Q8N4L8 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.16■■■□□ 2.74
CCDC24Q8N4L8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC24Q8N4L8 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.15■■■□□ 2.74
CCDC24Q8N4L8 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC24Q8N4L8 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC24Q8N4L8 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.14■■■□□ 2.74
CCDC24Q8N4L8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.13■■■□□ 2.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69 ms