Protein–RNA interactions for Protein: Q8N159

NAGS, N-acetylglutamate synthase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 534 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAGSQ8N159 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
NAGSQ8N159 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NAGSQ8N159 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
NAGSQ8N159 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAGSQ8N159 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
NAGSQ8N159 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
NAGSQ8N159 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAGSQ8N159 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
NAGSQ8N159 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAGSQ8N159 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAGSQ8N159 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAGSQ8N159 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
NAGSQ8N159 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NAGSQ8N159 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NAGSQ8N159 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
NAGSQ8N159 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
NAGSQ8N159 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
NAGSQ8N159 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
NAGSQ8N159 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
NAGSQ8N159 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 KCTD17-202ENST00000403888 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
NAGSQ8N159 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
NAGSQ8N159 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAGSQ8N159 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
NAGSQ8N159 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAGSQ8N159 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAGSQ8N159 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
NAGSQ8N159 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
NAGSQ8N159 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
NAGSQ8N159 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NAGSQ8N159 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
NAGSQ8N159 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NAGSQ8N159 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
NAGSQ8N159 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NAGSQ8N159 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NAGSQ8N159 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.08■■□□□ 1.61
NAGSQ8N159 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
NAGSQ8N159 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
NAGSQ8N159 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NAGSQ8N159 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
NAGSQ8N159 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
NAGSQ8N159 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.05■■□□□ 1.6
NAGSQ8N159 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
NAGSQ8N159 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NAGSQ8N159 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC25.04■■□□□ 1.6
NAGSQ8N159 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
NAGSQ8N159 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
NAGSQ8N159 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NAGSQ8N159 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NAGSQ8N159 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
NAGSQ8N159 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
NAGSQ8N159 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NAGSQ8N159 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
NAGSQ8N159 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NAGSQ8N159 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
NAGSQ8N159 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NAGSQ8N159 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NAGSQ8N159 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
NAGSQ8N159 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NAGSQ8N159 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NAGSQ8N159 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NAGSQ8N159 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NAGSQ8N159 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NAGSQ8N159 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
NAGSQ8N159 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NAGSQ8N159 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NAGSQ8N159 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
NAGSQ8N159 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms