Protein–RNA interactions for Protein: Q8N137

CNTROB, Centrobin, humanhuman

Predictions only

Length 903 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTROBQ8N137 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CNTROBQ8N137 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.1■■■□□ 2.73
CNTROBQ8N137 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC32.1■■■□□ 2.73
CNTROBQ8N137 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.09■■■□□ 2.73
CNTROBQ8N137 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.08■■■□□ 2.73
CNTROBQ8N137 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CNTROBQ8N137 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.08■■■□□ 2.73
CNTROBQ8N137 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC32.07■■■□□ 2.72
CNTROBQ8N137 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CNTROBQ8N137 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CNTROBQ8N137 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.07■■■□□ 2.72
CNTROBQ8N137 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CNTROBQ8N137 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CNTROBQ8N137 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.06■■■□□ 2.72
CNTROBQ8N137 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CNTROBQ8N137 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CNTROBQ8N137 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CNTROBQ8N137 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CNTROBQ8N137 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CNTROBQ8N137 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CNTROBQ8N137 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.04■■■□□ 2.72
CNTROBQ8N137 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CNTROBQ8N137 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CNTROBQ8N137 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CNTROBQ8N137 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CNTROBQ8N137 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC32.02■■■□□ 2.72
CNTROBQ8N137 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CNTROBQ8N137 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CNTROBQ8N137 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CNTROBQ8N137 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC32.02■■■□□ 2.72
CNTROBQ8N137 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CNTROBQ8N137 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CNTROBQ8N137 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CNTROBQ8N137 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC32■■■□□ 2.71
CNTROBQ8N137 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC32■■■□□ 2.71
CNTROBQ8N137 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CNTROBQ8N137 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CNTROBQ8N137 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC31.99■■■□□ 2.71
CNTROBQ8N137 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CNTROBQ8N137 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CNTROBQ8N137 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CNTROBQ8N137 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CNTROBQ8N137 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CNTROBQ8N137 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CNTROBQ8N137 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CNTROBQ8N137 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CNTROBQ8N137 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CNTROBQ8N137 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CNTROBQ8N137 PQLC1-202ENST00000357575 2475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CNTROBQ8N137 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CNTROBQ8N137 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.94■■■□□ 2.7
CNTROBQ8N137 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CNTROBQ8N137 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CNTROBQ8N137 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CNTROBQ8N137 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CNTROBQ8N137 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CNTROBQ8N137 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CNTROBQ8N137 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CNTROBQ8N137 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CNTROBQ8N137 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CNTROBQ8N137 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CNTROBQ8N137 ABHD17A-202ENST00000292577 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CNTROBQ8N137 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.7
CNTROBQ8N137 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC31.89■■■□□ 2.7
CNTROBQ8N137 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.89■■■□□ 2.69
CNTROBQ8N137 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CNTROBQ8N137 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CNTROBQ8N137 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CNTROBQ8N137 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CNTROBQ8N137 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CNTROBQ8N137 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CNTROBQ8N137 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC31.87■■■□□ 2.69
CNTROBQ8N137 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CNTROBQ8N137 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CNTROBQ8N137 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CNTROBQ8N137 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CNTROBQ8N137 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CNTROBQ8N137 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CNTROBQ8N137 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CNTROBQ8N137 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CNTROBQ8N137 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CNTROBQ8N137 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.85■■■□□ 2.69
CNTROBQ8N137 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC31.84■■■□□ 2.69
CNTROBQ8N137 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CNTROBQ8N137 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CNTROBQ8N137 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC31.82■■■□□ 2.68
CNTROBQ8N137 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CNTROBQ8N137 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CNTROBQ8N137 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CNTROBQ8N137 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CNTROBQ8N137 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CNTROBQ8N137 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
CNTROBQ8N137 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CNTROBQ8N137 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CNTROBQ8N137 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CNTROBQ8N137 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CNTROBQ8N137 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CNTROBQ8N137 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC31.78■■■□□ 2.68
CNTROBQ8N137 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC31.78■■■□□ 2.68
CNTROBQ8N137 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC31.77■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms