Protein–RNA interactions for Protein: Q8IWT6

LRRC8A, Volume-regulated anion channel subunit LRRC8A, humanhuman

Predictions only

Length 810 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRC8AQ8IWT6 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
LRRC8AQ8IWT6 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
LRRC8AQ8IWT6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC8AQ8IWT6 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC8AQ8IWT6 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC8AQ8IWT6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
LRRC8AQ8IWT6 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC8AQ8IWT6 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
LRRC8AQ8IWT6 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC8AQ8IWT6 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC8AQ8IWT6 PQLC1-211ENST00000590381 1247 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC8AQ8IWT6 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC8AQ8IWT6 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
LRRC8AQ8IWT6 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LRRC8AQ8IWT6 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.08
LRRC8AQ8IWT6 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC8AQ8IWT6 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC8AQ8IWT6 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
LRRC8AQ8IWT6 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC8AQ8IWT6 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC8AQ8IWT6 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC8AQ8IWT6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
LRRC8AQ8IWT6 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC8AQ8IWT6 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC8AQ8IWT6 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
LRRC8AQ8IWT6 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC8AQ8IWT6 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC8AQ8IWT6 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC8AQ8IWT6 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC8AQ8IWT6 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
LRRC8AQ8IWT6 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC8AQ8IWT6 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC8AQ8IWT6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC8AQ8IWT6 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC8AQ8IWT6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
LRRC8AQ8IWT6 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC8AQ8IWT6 CLEC3B-201ENST00000296130 936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC8AQ8IWT6 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
LRRC8AQ8IWT6 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC8AQ8IWT6 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC8AQ8IWT6 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
LRRC8AQ8IWT6 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC8AQ8IWT6 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC8AQ8IWT6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC8AQ8IWT6 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC8AQ8IWT6 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC8AQ8IWT6 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
LRRC8AQ8IWT6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC8AQ8IWT6 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC8AQ8IWT6 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC8AQ8IWT6 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC8AQ8IWT6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC8AQ8IWT6 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
LRRC8AQ8IWT6 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC8AQ8IWT6 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC8AQ8IWT6 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
LRRC8AQ8IWT6 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC8AQ8IWT6 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
LRRC8AQ8IWT6 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC8AQ8IWT6 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC8AQ8IWT6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
LRRC8AQ8IWT6 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
LRRC8AQ8IWT6 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.05
LRRC8AQ8IWT6 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC8AQ8IWT6 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC8AQ8IWT6 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
LRRC8AQ8IWT6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
LRRC8AQ8IWT6 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
LRRC8AQ8IWT6 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC8AQ8IWT6 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC8AQ8IWT6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
LRRC8AQ8IWT6 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC8AQ8IWT6 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC8AQ8IWT6 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC8AQ8IWT6 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC8AQ8IWT6 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
LRRC8AQ8IWT6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
LRRC8AQ8IWT6 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC8AQ8IWT6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.82■■■□□ 2.04
LRRC8AQ8IWT6 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC8AQ8IWT6 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC8AQ8IWT6 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC8AQ8IWT6 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC8AQ8IWT6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC27.81■■■□□ 2.04
LRRC8AQ8IWT6 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC8AQ8IWT6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC8AQ8IWT6 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
LRRC8AQ8IWT6 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC8AQ8IWT6 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
LRRC8AQ8IWT6 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC8AQ8IWT6 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC27.78■■■□□ 2.04
LRRC8AQ8IWT6 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.77■■■□□ 2.04
LRRC8AQ8IWT6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.04
LRRC8AQ8IWT6 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC8AQ8IWT6 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC8AQ8IWT6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC8AQ8IWT6 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC27.76■■■□□ 2.03
LRRC8AQ8IWT6 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC8AQ8IWT6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
LRRC8AQ8IWT6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.1 ms