Protein–RNA interactions for Protein: Q86XF0

DHFR2, Dihydrofolate reductase 2, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHFR2Q86XF0 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
DHFR2Q86XF0 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHFR2Q86XF0 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
DHFR2Q86XF0 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHFR2Q86XF0 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHFR2Q86XF0 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHFR2Q86XF0 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHFR2Q86XF0 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHFR2Q86XF0 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHFR2Q86XF0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHFR2Q86XF0 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
DHFR2Q86XF0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHFR2Q86XF0 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHFR2Q86XF0 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHFR2Q86XF0 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
DHFR2Q86XF0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHFR2Q86XF0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHFR2Q86XF0 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHFR2Q86XF0 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
DHFR2Q86XF0 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHFR2Q86XF0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
DHFR2Q86XF0 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHFR2Q86XF0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
DHFR2Q86XF0 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHFR2Q86XF0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
DHFR2Q86XF0 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DHFR2Q86XF0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
DHFR2Q86XF0 FAM58A-202ENST00000440428 1164 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHFR2Q86XF0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHFR2Q86XF0 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
DHFR2Q86XF0 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHFR2Q86XF0 H2AFV-202ENST00000308153 752 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
DHFR2Q86XF0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHFR2Q86XF0 ANAPC11-203ENST00000392376 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHFR2Q86XF0 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
DHFR2Q86XF0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHFR2Q86XF0 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
DHFR2Q86XF0 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHFR2Q86XF0 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
DHFR2Q86XF0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHFR2Q86XF0 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
DHFR2Q86XF0 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHFR2Q86XF0 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
DHFR2Q86XF0 AP002365.1-201ENST00000603448 772 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
DHFR2Q86XF0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHFR2Q86XF0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHFR2Q86XF0 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHFR2Q86XF0 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHFR2Q86XF0 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHFR2Q86XF0 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
DHFR2Q86XF0 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
DHFR2Q86XF0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DHFR2Q86XF0 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
DHFR2Q86XF0 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
DHFR2Q86XF0 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DHFR2Q86XF0 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
DHFR2Q86XF0 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DHFR2Q86XF0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
DHFR2Q86XF0 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DHFR2Q86XF0 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
DHFR2Q86XF0 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DHFR2Q86XF0 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DHFR2Q86XF0 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
DHFR2Q86XF0 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
DHFR2Q86XF0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC24.08■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 KLF16-203ENST00000592313 508 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 AC025431.1-201ENST00000559684 874 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 GNPTAB-202ENST00000392919 760 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
DHFR2Q86XF0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms