Protein–RNA interactions for Protein: Q86W67

FAM228A, Protein FAM228A, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM228AQ86W67 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM228AQ86W67 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM228AQ86W67 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM228AQ86W67 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM228AQ86W67 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM228AQ86W67 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM228AQ86W67 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM228AQ86W67 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
FAM228AQ86W67 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM228AQ86W67 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM228AQ86W67 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM228AQ86W67 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
FAM228AQ86W67 GNAI2-202ENST00000313601 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM228AQ86W67 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM228AQ86W67 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
FAM228AQ86W67 ATRNL1-207ENST00000527407 1583 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
FAM228AQ86W67 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM228AQ86W67 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM228AQ86W67 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
FAM228AQ86W67 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM228AQ86W67 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM228AQ86W67 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM228AQ86W67 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.27■■■□□ 2.12
FAM228AQ86W67 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM228AQ86W67 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM228AQ86W67 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM228AQ86W67 ATPAF1-202ENST00000371937 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM228AQ86W67 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
FAM228AQ86W67 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM228AQ86W67 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM228AQ86W67 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
FAM228AQ86W67 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM228AQ86W67 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC28.24■■■□□ 2.11
FAM228AQ86W67 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM228AQ86W67 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
FAM228AQ86W67 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM228AQ86W67 MBOAT7-202ENST00000338624 2076 ntTSL 2 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM228AQ86W67 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM228AQ86W67 RAMP2-AS1-202ENST00000589716 1985 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM228AQ86W67 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
FAM228AQ86W67 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM228AQ86W67 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM228AQ86W67 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM228AQ86W67 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM228AQ86W67 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
FAM228AQ86W67 ANGPTL6-201ENST00000253109 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FAM228AQ86W67 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
FAM228AQ86W67 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM228AQ86W67 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM228AQ86W67 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM228AQ86W67 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM228AQ86W67 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM228AQ86W67 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM228AQ86W67 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM228AQ86W67 NRXN1-228ENST00000628364 2444 ntTSL 5 BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM228AQ86W67 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
FAM228AQ86W67 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM228AQ86W67 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM228AQ86W67 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
FAM228AQ86W67 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM228AQ86W67 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM228AQ86W67 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM228AQ86W67 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM228AQ86W67 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
FAM228AQ86W67 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM228AQ86W67 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM228AQ86W67 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
FAM228AQ86W67 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM228AQ86W67 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
FAM228AQ86W67 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM228AQ86W67 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM228AQ86W67 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM228AQ86W67 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.14■■■□□ 2.1
FAM228AQ86W67 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM228AQ86W67 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM228AQ86W67 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM228AQ86W67 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
FAM228AQ86W67 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM228AQ86W67 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM228AQ86W67 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM228AQ86W67 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM228AQ86W67 ST7-AS1-201ENST00000456775 1889 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
FAM228AQ86W67 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM228AQ86W67 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM228AQ86W67 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
FAM228AQ86W67 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM228AQ86W67 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM228AQ86W67 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.1■■■□□ 2.09
FAM228AQ86W67 ARL8A-201ENST00000272217 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM228AQ86W67 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM228AQ86W67 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM228AQ86W67 PI4KAP2-202ENST00000450651 2294 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM228AQ86W67 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
FAM228AQ86W67 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM228AQ86W67 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM228AQ86W67 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM228AQ86W67 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM228AQ86W67 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
FAM228AQ86W67 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.08
FAM228AQ86W67 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.5 ms