Protein–RNA interactions for Protein: Q86UT5

PDZD3, Na(+)/H(+) exchange regulatory cofactor NHE-RF4, humanhuman

Predictions only

Length 571 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDZD3Q86UT5 GIPC1-203ENST00000393033 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZD3Q86UT5 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
PDZD3Q86UT5 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZD3Q86UT5 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
PDZD3Q86UT5 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZD3Q86UT5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZD3Q86UT5 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC25.35■■□□□ 1.65
PDZD3Q86UT5 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZD3Q86UT5 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZD3Q86UT5 PCSK6-201ENST00000331826 2309 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZD3Q86UT5 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
PDZD3Q86UT5 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZD3Q86UT5 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZD3Q86UT5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZD3Q86UT5 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
PDZD3Q86UT5 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZD3Q86UT5 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZD3Q86UT5 KMT2E-AS1-201ENST00000453677 736 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZD3Q86UT5 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZD3Q86UT5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZD3Q86UT5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PDZD3Q86UT5 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZD3Q86UT5 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZD3Q86UT5 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZD3Q86UT5 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PDZD3Q86UT5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZD3Q86UT5 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZD3Q86UT5 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZD3Q86UT5 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PDZD3Q86UT5 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZD3Q86UT5 BCL3-201ENST00000164227 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZD3Q86UT5 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZD3Q86UT5 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PDZD3Q86UT5 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZD3Q86UT5 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZD3Q86UT5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PDZD3Q86UT5 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PDZD3Q86UT5 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZD3Q86UT5 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZD3Q86UT5 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZD3Q86UT5 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZD3Q86UT5 NGB-201ENST00000298352 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PDZD3Q86UT5 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PDZD3Q86UT5 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZD3Q86UT5 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PDZD3Q86UT5 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZD3Q86UT5 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZD3Q86UT5 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PDZD3Q86UT5 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZD3Q86UT5 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZD3Q86UT5 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZD3Q86UT5 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZD3Q86UT5 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PDZD3Q86UT5 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZD3Q86UT5 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZD3Q86UT5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZD3Q86UT5 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZD3Q86UT5 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZD3Q86UT5 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PDZD3Q86UT5 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZD3Q86UT5 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZD3Q86UT5 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PDZD3Q86UT5 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZD3Q86UT5 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZD3Q86UT5 WHRN-203ENST00000374057 1718 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZD3Q86UT5 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZD3Q86UT5 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PDZD3Q86UT5 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZD3Q86UT5 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZD3Q86UT5 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PDZD3Q86UT5 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZD3Q86UT5 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZD3Q86UT5 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZD3Q86UT5 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZD3Q86UT5 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZD3Q86UT5 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PDZD3Q86UT5 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZD3Q86UT5 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZD3Q86UT5 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.15■■□□□ 1.62
PDZD3Q86UT5 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZD3Q86UT5 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
PDZD3Q86UT5 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
PDZD3Q86UT5 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZD3Q86UT5 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZD3Q86UT5 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
PDZD3Q86UT5 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZD3Q86UT5 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZD3Q86UT5 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZD3Q86UT5 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZD3Q86UT5 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZD3Q86UT5 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZD3Q86UT5 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZD3Q86UT5 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZD3Q86UT5 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZD3Q86UT5 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZD3Q86UT5 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZD3Q86UT5 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZD3Q86UT5 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZD3Q86UT5 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
PDZD3Q86UT5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.8 ms